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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001076`

染色体: Chr07 坐标: 7907454-7910282 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001076`
名称	SmilChr07G001076
描述	glyoxylate/hydroxypyruvate/pyruvate reductase 2KGR-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	7907454 - 7910282 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992249`
GeneID	`130992249`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992249`
原始查询	`SmilChr07G001076`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glyoxylate/hydroxypyruvate/pyruvate reductase 2KGR-like
产物	glyoxylate/hydroxypyruvate/pyruvate reductase 2KGR-like
Arabidopsis	`AT1G79870` (AT1G79870) D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844326] identity=65.5; qcov=1; evalue=1.05e-146; confidence=high
Rice	`Os01g0228600` (OsHPR2-1) - identity=63.3; qcov=1.01; evalue=1.47e-144; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0016618 (hydroxypyruvate reductase [NAD(P)H] activity); GO:0030267 (glyoxylate reductase (NADPH) activity); GO:0051287 (NAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF00389 (2-Hacid_dh); PF02826 (2-Hacid_dh_C); PF03446 (NAD_binding_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992249

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057772784.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057772784.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057772784.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772784.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772784.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:7907783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,C33,C46,D7
`Chr7:7907824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,D4
`Chr7:7907929`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:7907991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A23,B123,B128,B136,B137,B32,B86,B88,B91,C10,C13,C44,C59,C62
`Chr7:7908021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,C33,C46
`Chr7:7908158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:7908174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr7:7908191`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C27
`Chr7:7908191`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C27
`Chr7:7908235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:7908255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr7:7909624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,C33,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772784.1

313 aa

156

313

2-Hacid_dh

2-Hacid_dh_C

NAD_binding_2

PF00389 2-Hacid_dh 8-310 aa PF02826 2-Hacid_dh_C 109-281 aa PF03446 NAD_binding_2 147-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772784.1`	Pfam	`PF00389`	2-Hacid_dh	Domain	8	310	5e-23	82.0	D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic domain
`XP_057772784.1`	Pfam	`PF02826`	2-Hacid_dh_C	Domain	109	281	3.9e-50	170.4	D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD binding domain
`XP_057772784.1`	Pfam	`PF03446`	NAD_binding_2	Domain	147	243	3.5e-05	24.6	NAD binding domain of 6-phosphogluconate dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916801.1
GTATTGTAAAAAGATTAAACTTTAGATAAAATTATCACTACACTAGTAGTGTTTTTCCATGCGATATGTATATATATGAGATTTCTTCATTGATAACTATGGATTTCTTGATTCGAGCAGTGTTTTTTCATTTCTTATGTATATGTGGTTGTATCAAACCACAAGATTTCAATCACAAATTCGAATCGTGCATATAGCTTTATATATCTAAAGGATTTCTTGATTCAAGCAGTGTTTTTTTTCATTTTGCAGAGCGAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992249
ATGGAGAATGTGGGAGTGATGATGACCACTCCAATGTCAGCCTATCTGGAGCAACAGCTCCAGCAGCGCTTCACACTCTTCAAGCTTTGGGAATCGTCCTCCCGAACTCAGTTCCTCACTCGGCGCGCCGACTCAGTCAATGCGGTGGTCGGCGACACCAAAATCGGCGCCGATTCCGAGCTGATTGACTCGCTCCCCCGCCTCGAGATCGTCTCCACTTACAGCGTCGGCCTCGATAAAATCGACTTGGACAAGTGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772784.1
MENVGVMMTTPMSAYLEQQLQQRFTLFKLWESSSRTQFLTRRADSVNAVVGDTKIGADSELIDSLPRLEIVSTYSVGLDKIDLDKCRERGIRVTNTPDVLTDDVADLAIGLALTTLRRICACDAFVRSGSWRNGDFQLATKFSGKSVGILGLGRIGSAIAKRAKAFGCTIGYHSRTKKQITDYMYHSNAVDLAANCRILFVACSLTDETRHIVNREVIDALGPGGVLVNVGRGALVDEHELVSALCEGRLGGAGLDVFEN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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