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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001080`

染色体: Chr07 坐标: 7924246-7926985 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001080`
名称	SmilChr07G001080
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 35
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	7924246 - 7926985 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992254`
GeneID	`130992254`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992254`
原始查询	`SmilChr07G001080`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 35
产物	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 35
Arabidopsis	`AT5G51280` (AT5G51280) DEAD-box protein abstrakt [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835202] identity=87.3; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0697200` (OsRH35B) - identity=72.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0003723 (RNA binding); GO:0003724 (RNA helicase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005681 (spliceosomal complex); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC); PF00270 (DEAD); PF00271 (Helicase_C); PF04851 (ResIII)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992254

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772789.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057772789.1`
3	Chromatin	染色质	0.40000	`XP_057772789.1`
4	Nuclear speckle	核斑点	0.40000	`XP_057772789.1`
5	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.40000	`XP_057772789.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:7924919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:7924968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:7925009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr7:7925353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr7:7925654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr7:7926004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr7:7926216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr7:7926264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:7926444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,D10
`Chr7:7926540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr7:7926574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr7:7926642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772789.1

595 aa

298

595

DEAD

ResIII

Helicase_C

zf-CCHC

PF00270 DEAD 174-353 aa PF04851 ResIII 194-347 aa PF00271 Helicase_C 389-496 aa PF00098 zf-CCHC 553-569 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772789.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	174	353	5.8e-41	140.7	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057772789.1`	Pfam	`PF04851`	ResIII	Family	194	347	1e-05	26.3	Type III restriction enzyme, res subunit
`XP_057772789.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	389	496	8.3e-32	110.4	Helicase conserved C-terminal domain
`XP_057772789.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	553	569	0.00034	21.3	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916806.1
AATCGAGCCTAAATAGGCTTGGTATCAAACTCACTTCAAAAAGAGACTTCATATCAAACTCTCTAAAAAAATCATAAAGAAAAAAAAGAAACTAGAAAAACCGCCTTTTGACCTTCGTTGCTGAGGAAGGATTATCACAATTCACACAATCATTGTTACTCGTTAGCTCTTAACCGGAAACCTCCCCCGCTACATCTACCATCTTCTTCTCCGTTCCACCTCAAGATTCTTAAACATGGGTTCACATGGTGAGGATGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992254
ATGGGTTCACATGGTGAGGATGTGATGGAAGAGGAAGATGATTACGTTGAGTATGTTCCTGTGGCAAAGCGGCGTGCGCTTGAGGCGCAGAAGATTTTGCAGCGTAGGGGGAAGTCTTCCGCACTCGATGAGGAGATCGAGAAACAGAATCTCGTGGAGGCGAAACCTAGTCTACTGGTGAAAGCTTCTCAACTGAAGAAAGATCAGCCGGAGATCACCCAAACCGAGCAGATAATACTACAGGAGAAGGAGATGATCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772789.1
MGSHGEDVMEEEDDYVEYVPVAKRRALEAQKILQRRGKSSALDEEIEKQNLVEAKPSLLVKASQLKKDQPEITQTEQIILQEKEMIEHLSDRKTLMSVRELAKGITYTDPLLTGWKPPLPIRRMSSKACDAIRRQWHIIVDGEDIPPPIKNFKDMRFPQPILKKLKAKGIVQPTPIQVQGLPVILSGRDMIGIAFTGSGKTLVFVLPLIMIALQEEIMMPITPGEGPFGLVVCPSRELARQTYEVVELFLESLKEAGYPE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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