当前解析结果
SmilChr07G001083| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001083 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001083 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G001083 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 7928740 - 7931572 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130992255 |
|---|---|
| GeneID | 130992255 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992255 |
| 原始查询 | SmilChr07G001083 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os02g0802400; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os02g0802400; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT3G18430 (AT3G18430)Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821372] identity=75.4; qcov=1; evalue=1.2e-97; confidence=high |
| Rice | Os02g0802400- identity=72; qcov=1; evalue=4.19e-98; confidence=high |
| GO | GO:0005509 (calcium ion binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF13405 (EF-hand_6); PF13499 (EF-hand_7); PF13833 (EF-hand_8) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992255 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057772790.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057772790.1 |
| 3 | Cell projection | 细胞突起 | 0.40000 | XP_057772790.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057772790.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057772790.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057772790.1PF13833
EF-hand_8 78-122 aa
PF13499
EF-hand_7 94-160 aa
PF13405
EF-hand_6 96-123 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057772790.1 |
Pfam | PF13833 |
EF-hand_8 | Domain | 78 | 122 | 2.5e-07 | 31.1 | EF-hand domain pair |
XP_057772790.1 |
Pfam | PF13499 |
EF-hand_7 | Domain | 94 | 160 | 7.3e-12 | 46.2 | EF-hand domain pair |
XP_057772790.1 |
Pfam | PF13405 |
EF-hand_6 | Domain | 96 | 123 | 2.7e-11 | 42.8 | EF-hand domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。