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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001096`

染色体: Chr07 坐标: 8069374-8073010 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001096`
名称	SmilChr07G001096
描述	uncharacterized SmilChr07G001096
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8069374 - 8073010 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992270`
GeneID	`130992270`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992270`
原始查询	`SmilChr07G001096`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ubiquitin system component Cue protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833203]; symbol=AT5G32440; hit=AT5G32440; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ubiquitin system component Cue protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833203]; symbol=AT5G32440; hit=AT5G32440; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G32440` (AT5G32440) Ubiquitin system component Cue protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833203] identity=47.7; qcov=1.03; evalue=1.14e-71; confidence=high
Rice	`Os06g0642900` - identity=45.2; qcov=1.07; evalue=5.88e-70; confidence=high
GO	GO:0043130 (ubiquitin binding)
KEGG	-
Pfam	PF02845 (CUE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992270

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772816.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057772816.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772816.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772816.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772816.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8069573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr7:8069578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr7:8069601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr7:8069612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C73
`Chr7:8069759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,D4
`Chr7:8070301`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B37
`Chr7:8070301`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B37
`Chr7:8072037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,C10,C42
`Chr7:8072706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772816.1

273 aa

136

273

CUE

PF02845 CUE 53-88 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772816.1`	Pfam	`PF02845`	CUE	Domain	53	88	4.5e-05	23.7	CUE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916833.1
CCACCTCCGCCGCCGCAGAATATTTGTCAAGAGGAAAACAGATGTCGAGGGAAAGTACATCTCTACCCTGAAGCAAAAGCTTGGAATCTCTCCGATGCACCCCCAAAACCCTAGCCCTAATTCCTGATTCCTGATTCAATTCCTATTCATTTTGAATTCCAGAAACACAAGATTAATCGAATTTATAATTAATTTCTTTTAATTCAACAAAAATGTCAGCGATTGTGTGTGGCAAGAGGTCGTTCTTCGAGGACATCGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992270
ATGTCAGCGATTGTGTGTGGCAAGAGGTCGTTCTTCGAGGACATCGACGCCACGGCGTCATCGCCGGACTCTGCATCGCCGCCAGCTTACAAGAAGTTCCGATGCTCTTCGTCCACGTCACCGGTCCGGTTCACGTACTCCCCGCCGGTTCAAACGAGTTCGGTTGATCAGCTCAAGGCTTTGTTTCCTGAGCTGGAAATTCAGCTTTTAGAGAAAGCTATGGAAGAGTCCGTCAATGACTTGGATTTGGCTATTAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772816.1
MSAIVCGKRSFFEDIDATASSPDSASPPAYKKFRCSSSTSPVRFTYSPPVQTSSVDQLKALFPELEIQLLEKAMEESVNDLDLAIKKLHEFCRGHDVNDKIGTSAEENATMDKAASQTGGDSVPLQEPQSQNNLPADGAEWVDLFVREMMNASSIDDARFRAASILESLEKSISSRASVETAQSFHKENLMLKEHIEVLLRDNVILKRAVAIQHERQKENDEKNQEVQHIKQLLAQYQEQLRTLEANNYALTLRLQHAQL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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