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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001101`

染色体: Chr07 坐标: 8121195-8122470 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001101`
名称	SmilChr07G001101
描述	la-related protein 1A-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8121195 - 8122470 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992276`
GeneID	`130992276`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992276`
原始查询	`SmilChr07G001101`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	la-related protein 1A-like
产物	la-related protein 1A-like
Arabidopsis	`AT5G66100` (LARP1b) winged-helix DNA-binding transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836742] identity=37.2; qcov=0.68; evalue=1.35e-26; confidence=medium
Rice	`Os03g0156500` - identity=44.3; qcov=0.482; evalue=5e-26; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006396 (RNA processing); GO:1990904 (ribonucleoprotein complex)
KEGG	-
Pfam	PF05383 (La)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992276

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772824.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057772824.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057772824.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772824.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772824.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8121266`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B2
`Chr7:8121266`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B2
`Chr7:8121298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B17,B6,C67
`Chr7:8121301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B17,B6,C67
`Chr7:8121327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B49,B61
`Chr7:8121448`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C4
`Chr7:8121448`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C4
`Chr7:8121492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B39,C17
`Chr7:8121506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,B72
`Chr7:8121511`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B4,C21,C37,C64,C66,C73
`Chr7:8121537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,C11,C69
`Chr7:8121588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772824.1

253 aa

126

253

PF05383 La 146-202 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772824.1`	Pfam	`PF05383`	La	Domain	146	202	2.7e-23	82.3	La domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916841.1
TGAAATCGTCAGCTGCAAGATCAATGCCTAATGATCGACGTCAGGTGGCGCCACCACCACCACCACCGCCACAACCAGTTTTCTTCCCTTATAACCATCCATACGCGTACACGCCGCCGCCTGTATCTTGGTCGTTTGTTCGTCCACAACTACCTATACCCTCTTGGGACAACCATACTTACGTTTATACTCAAACACTGCCTTCATTATCTTCATTTGTTTCTCCACCACCACCACCAACACCGCCTTCTTTGCCTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992276
ATGCCTAATGATCGACGTCAGGTGGCGCCACCACCACCACCACCGCCACAACCAGTTTTCTTCCCTTATAACCATCCATACGCGTACACGCCGCCGCCTGTATCTTGGTCGTTTGTTCGTCCACAACTACCTATACCCTCTTGGGACAACCATACTTACGTTTATACTCAAACACTGCCTTCATTATCTTCATTTGTTTCTCCACCACCACCACCAACACCGCCTTCTTTGCCTTTTTGGAACAATGCTCAAACATTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772824.1
MPNDRRQVAPPPPPPPQPVFFPYNHPYAYTPPPVSWSFVRPQLPIPSWDNHTYVYTQTLPSLSSFVSPPPPPTPPSLPFWNNAQTLHPPSFPTPTPAPPFPLAYNTPPLMHPPSFPTPTPSAPPLPLHPPSNSFPPNKEEDLSHKILKQIEYYFCDNNLAKDLHLKDQMDIDNGWVSIEVIAGFNRIKEMTDDIKLILDSLKHSDTIEVEGDKLRRRTTWKKWIAYRKVAPYGIKVVRSNSHQLRNVKQRQRN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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