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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001115`

染色体: Chr07 坐标: 8269897-8271292 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001115`
名称	SmilChr07G001115
描述	serine carboxypeptidase-like 50
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8269897 - 8271292 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992289`
GeneID	`130992289`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992289`
原始查询	`SmilChr07G001115`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine carboxypeptidase-like 50
产物	serine carboxypeptidase-like 50
Arabidopsis	`AT1G15000` (scpl50) serine carboxypeptidase-like 50 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838065] identity=56.3; qcov=1.01; evalue=2.8e-145; confidence=high
Rice	`Os05g0582800` (OsSCP31) - identity=55.1; qcov=1; evalue=6.36e-136; confidence=high
GO	GO:0004185 (serine-type carboxypeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00450 (Peptidase_S10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992289

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057772838.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057772838.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057772838.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772838.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772838.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8270017`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr7:8270155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,C30,C7,C84
`Chr7:8270168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C9
`Chr7:8270174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr7:8270180`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	50	A1,A13,A22,A25,A5,A9,B105,B107,B118,B119,B128,B129,B135,B136,B19,B21,B27,B32,B41,B44,B54,B59,B62,B69,B71,B73,B82,B88,B9,B91,B99,C1,C19,C22,C26,C34,C35,C44,C51,C56,C59,C6,C62,C74,C76,C77,C80,C81,C83,D6
`Chr7:8270205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	44	A1,A13,A22,A5,A9,B105,B107,B118,B119,B128,B129,B135,B136,B19,B21,B27,B32,B41,B44,B54,B59,B62,B69,B71,B82,B88,B91,B99,C1,C19,C22,C34,C35,C44,C51,C56,C59,C6,C74,C77,C80,C81,C83,D6
`Chr7:8270273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr7:8270372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B17,B6,C21,C67
`Chr7:8270444`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	76	A1,A13,A22,A23,A5,A9,B105,B107,B108,B109,B117,B118,B119,B120,B121,B128,B129,B132,B135,B136,B15,B21,B24,B27,B3,B32,B37,B40,B41,B44,B45,B47,B52,B54,B57,B58,B59,B60,B62,B63,B69,B7,B73,B82,B86,B87,B88,B9,B91,B99,C1,C13,C19,C22,C24,C34,C35,C38,C39,C40,C44,C49,C51,C52,C56,C6,C65,C74,C75,C76,C77,C79,C80,C83,C9,D2
`Chr7:8270531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B104,B110,B72,C14
`Chr7:8270690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr7:8270805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772838.1

361 aa

180

361

Peptidase_S10

PF00450 Peptidase_S10 1-345 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772838.1`	Pfam	`PF00450`	Peptidase_S10	Domain	1	345	1.6e-75	255.8	Serine carboxypeptidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916855.1
AAGCTTTTCCCAAATGGTATAAACAGGCAGAATATTAAAGCCACATAGTTTCACTTTTTTATAAAGTAGGACAAAAGTCTCCAGTCATCACTCACTGCACTGCCTACACCCCAAAAAATGGAGTCAATTCCACCACCTCCTCTTCTTCTTCCTCAGCATCATTGCTGTCCTCCGCCACTCCACCGCTGTGTCACCCTTCCCCAAGGAAGCAAAAGCTCAAAACTCCTTCAACATGATTTGGCTTCAAGGCGGGGCGGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992289
ATGATTTGGCTTCAAGGCGGGGCGGGCTGCTCATCGATGCTAGCCAACTTCTACGAGTTTGGGCCGTGGCTAGTGAAGCAAGATCTCTCACTCGGGCCTAATCCAGGTTCTTGGAACAGAATCTTTGGATTGATGTTTCTTGATAATCCTATAGGCTCTGGCTTCAGTATTGCTGCTTCAACTCAAGAAATCCCTCGGAACCAATACGATGTGGCTGAGCATCTCTTTGTAGCAATCAAGAAGTTCATTGGTTTGGATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772838.1
MIWLQGGAGCSSMLANFYEFGPWLVKQDLSLGPNPGSWNRIFGLMFLDNPIGSGFSIAASTQEIPRNQYDVAEHLFVAIKKFIGLDATFKSRPVYITGESYAGKYVLAIGYYNLKKNPSLKIESRVNLAGVAIGNSLTDPELQVATHAVNAYHLGLINDKQKALLEEIQLEAVGHVRRGCWXEATDARTRVLNTLTNMTGLATLYDSXRLTPYEDDLVAEFLNNVEAKRALGANDVMGDVLKDDVMKSVRYMVEFLVKNT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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