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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001127`

染色体: Chr07 坐标: 8447498-8448978 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001127`
名称	SmilChr07G001127
描述	embryo-specific protein ATS3B-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8447498 - 8448978 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992301`
GeneID	`130992301`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992301`
原始查询	`SmilChr07G001127`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	embryo-specific protein ATS3B-like
产物	embryo-specific protein ATS3B-like
Arabidopsis	`AT5G62200` (AT5G62200) Embryo-specific protein 3, (ATS3) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836341] identity=59.3; qcov=0.699; evalue=2.02e-55; confidence=high
Rice	`Os01g0172800` - identity=48.2; qcov=0.731; evalue=4.76e-36; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF06232 (ATS3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992301

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057772852.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772852.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772852.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772852.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772852.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8447667`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	41	A10,A13,A14,A19,B1,B10,B101,B104,B105,B130,B14,B25,B26,B38,B48,B52,B64,B65,B68,B71,B72,B73,B78,B90,B92,B98,C16,C20,C21,C23,C25,C4,C42,C51,C55,C72,C83,D10,D11,D7,D9
`Chr7:8448660`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B25,B69
`Chr7:8448661`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A13,A14,B1,B101,B105,B112,B48,B52,B68,B71,B78,B89,B98,C55,C72,D10
`Chr7:8448753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B14,C33,C46,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772852.1

193 aa

193

ATS3

PF06232 ATS3 65-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772852.1`	Pfam	`PF06232`	ATS3	Domain	65	182	3.9e-49	166.4	Embryo-specific protein 3, (ATS3)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916869.1
TTGAATCGCCACCAAACCTGGGACGTGGCTGTTGCATCTCTATTTCTCGAACCATCTCATCTGCAGCGCCTACTTCACAGATCTCAAGTTTTTGTTAAGAATCATGAAACCCCTAATTTTCCTGCTAATTCATGCTCTCGTCTTCTGTTATGCACAATCAAGATCCATCACCCCCCATCTCTCAAAATCAACACAACCCAGAATGCGAGAAGCTGTTCGTTTACTGTAAGCATTAGGACCAGTTGCTCGTCTACTCGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992301
TTGAATCGCCACCAAACCTGGGACGTGGCTGTTGCATCTCTATTTCTCGAACCATCTCATCTGCAGCGCCTACTTCACAGATCTCAAGTTTTTGTTAAGAATCATGAAACCCCTAATTTTCCTGCTAATTCATGCTCTCGTCTTCTGTTATGCACAATCAAGATCCATCACCCCCCATCTCTCAAAATCAACACAACCCAGAATGCGAGAAGCTGTTCGTTTACTGTAAGCATTAGGACCAGTTGCTCGTCTACTCGATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772852.1
LNRHQTWDVAVASLFLEPSHLQRLLHRSQVFVKNHETPNFPANSCSRLLLCTIKIHHPPSLKINTTQNARSCSFTVSIRTSCSSTRFTRDHISLAFGDAYGTQVYAPHLDDPSSRTFESCSTDTFQISGPCQYQICYLYLYRSGYDGWIPYDVTVYGYNSKPSTFFYNVNIPSDIWYGYNYCSGTRATSSAAK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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