当前解析结果
SmilChr07G001139| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001139 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001139 |
| 描述 | glyoxylase I 4-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 8550607 - 8552180 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992312 |
|---|---|
| GeneID | 130992312 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992312 |
| 原始查询 | SmilChr07G001139 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | glyoxylase I 4-like |
| 产物 | glyoxylase I 4-like |
| Arabidopsis | AT1G15380 (GLYI4)Lactoylglutathione lyase / glyoxalase I family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838107] identity=70.8; qcov=0.966; evalue=5.91e-89; confidence=high |
| Rice | Os05g0171900 (OsGLYI6)- identity=62.2; qcov=0.927; evalue=4.28e-76; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00903 (Glyoxalase); PF13669 (Glyoxalase_4) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992312 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057772869.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057772869.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057772869.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057772869.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057772869.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:8551012 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C23,D10 |
Chr7:8551232 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B44 |
Chr7:8551948 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B27,B91,C19,C31 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057772869.1PF00903
Glyoxalase 14-132 aa
PF13669
Glyoxalase_4 15-113 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057772869.1 |
Pfam | PF00903 |
Glyoxalase | Domain | 14 | 132 | 1.5e-13 | 51.9 | Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily |
XP_057772869.1 |
Pfam | PF13669 |
Glyoxalase_4 | Family | 15 | 113 | 1.2e-06 | 29.5 | Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。