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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001143`

染色体: Chr07 坐标: 8589620-8590343 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001143`
名称	SmilChr07G001143
描述	probable transcription factor At5g28040
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8589620 - 8590343 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993780`
GeneID	`130993780`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993780`
原始查询	`SmilChr07G001143`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable transcription factor At5g28040
产物	probable transcription factor At5g28040
Arabidopsis	`AT5G28040` (AT5G28040) DNA-binding storekeeper protein-related transcriptional regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832874] identity=44.4; qcov=0.974; evalue=5.02e-50; confidence=medium
Rice	`Os07g0636100` - identity=40.2; qcov=0.738; evalue=1.42e-34; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF04504 (GeBP-like_DBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993780

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774800.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774800.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774800.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774800.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774800.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8589625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B36,B53,B78,B91,C4
`Chr7:8589637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,B78,B96,C14
`Chr7:8589638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B57,B79,C76
`Chr7:8589644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B39,B53,B79,B87
`Chr7:8589653`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C22
`Chr7:8589653`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C22
`Chr7:8589657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B12,B131
`Chr7:8589661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C23
`Chr7:8589667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B96,C48
`Chr7:8589672`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	50	A11,A13,A21,A25,B101,B107,B119,B121,B126,B129,B133,B14,B18,B24,B33,B39,B44,B48,B49,B5,B51,B65,B68,B72,B74,B76,B86,B87,B89,B92,B93,C14,C15,C17,C22,C28,C3,C34,C54,C68,C74,C78,C80,C81,C85,D1,D11,D3,D5,D6
`Chr7:8589691`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	34	A1,A16,A24,B106,B109,B110,B117,B121,B134,B139,B21,B31,B32,B37,B44,B46,B47,B55,B57,B64,B67,B71,C15,C23,C26,C30,C38,C40,C41,C47,C75,C79,C84,D3
`Chr7:8589703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B100,B2,B34,C48,C53,C62,C83,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774800.1

229 aa

114

229

GeBP-like_DBD

PF04504 GeBP-like_DBD 64-163 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774800.1`	Pfam	`PF04504`	GeBP-like_DBD	Domain	64	163	9.7e-29	100.6	Glabrous-enhancer-binding protein-like family, DBD domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918817.1
AACACCGTTAACGACAACGATTCTGCCTCCTCCGCCCCCGTCGCCGTCGATCGCCCCCCTCCCTCCCCCGTCTCCGCCGCTCAGGTCACGATCGCCGTCCCTGGCCTCCCCGATCCCCACCACCAACAGCAAATTCAGCCGGAGATCGCGAAGAAGCCGACGCCGCCGCCCGATGAATCGCGGAAGCTGTTCCAGCGCCTCTGGACCGACGAGGACGAGATTGAGCTGCTGCAGGGGTTCCTCGATTACACCACCCAGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993780
AACACCGTTAACGACAACGATTCTGCCTCCTCCGCCCCCGTCGCCGTCGATCGCCCCCCTCCCTCCCCCGTCTCCGCCGCTCAGGTCACGATCGCCGTCCCTGGCCTCCCCGATCCCCACCACCAACAGCAAATTCAGCCGGAGATCGCGAAGAAGCCGACGCCGCCGCCCGATGAATCGCGGAAGCTGTTCCAGCGCCTCTGGACCGACGAGGACGAGATTGAGCTGCTGCAGGGGTTCCTCGATTACACCACCCAGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774800.1
NTVNDNDSASSAPVAVDRPPPSPVSAAQVTIAVPGLPDPHHQQQIQPEIAKKPTPPPDESRKLFQRLWTDEDEIELLQGFLDYTTQRCGPHNSSQHHHDTTAFYDQIRSKFQLDFYQNQLVEMLRRLKKKYRNVISKFGTGKEYTFKSPHEQATFEISSKIWGNSAVNGAAAYRTPPVPIDEDEDGINNPNFNNFVDCQSPKTSSIDKNAKTPRSRKRNCAGAAAEAIS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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