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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001148`

染色体: Chr07 坐标: 8626055-8631363 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001148`
名称	SmilChr07G001148
描述	peptidyl serine alpha-galactosyltransferase
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8626055 - 8631363 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992324`
GeneID	`130992324`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992324`
原始查询	`SmilChr07G001148`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl serine alpha-galactosyltransferase
产物	peptidyl serine alpha-galactosyltransferase
Arabidopsis	`AT3G01720` (AT3G01720) peptidyl serine alpha-galactosyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821091] identity=67.2; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0904500` - identity=64; qcov=0.952; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	smil00514 (Other types of O-glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF23452 (HPAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992324

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057772895.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057772895.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772895.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772895.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772895.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8626430`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	162	A1,A10,A15,A16,A2,A20,A22,A25,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B102,B103,B105,B106,B107,B11,B113,B115,B117,B118,B119,B12,B123,B126,B127,B128,B129,B130,B131,B135,B137,B138,B14,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B23,B24,B27,B31,B32,B33,B35,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B45,B46,B47,B48,B5,B50,B53,B54,B55,B56,B59,B6,B60,B62,B65,B67,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B74,B75,B78,B79,B8,B80,B82,B85,B87,B88,B9,B92,B95,B96,B97,B99,C1,C10,C12,C13,C14,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C25,C26,C28,C3,C31,C32,C33,C34,C37,C38,C4,C42,C43,C44,C46,C47,C5,C50,C51,C53,C54,C56,C57,C59,C6,C61,C62,C63,C65,C67,C68,C71,C73,C74,C76,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C85,C87,C9,D1,D2,D3,D4,D6,D7
`Chr7:8627116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B55,B69
`Chr7:8627158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr7:8629128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B72,B90,B92,C21,C25
`Chr7:8629294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr7:8629331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr7:8629357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:8629441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr7:8629484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr7:8629509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B136,B73
`Chr7:8629537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:8630061`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772895.1

840 aa

420

840

HPAT

PF23452 HPAT 31-243 aa PF23452 HPAT 396-605 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772895.1`	Pfam	`PF23452`	HPAT	Domain	31	243	3.1e-34	119.6	Hydroxyproline O-arabinosyltransferase family N-terminal domain
`XP_057772895.1`	Pfam	`PF23452`	HPAT	Domain	396	605	3.1e-34	119.6	Hydroxyproline O-arabinosyltransferase family N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916912.1
AGCTAGATCACCTCTGCGAGACTGCGACAAACTTATAACATTTCTTCAAATTAATTCTCACAAATTCAGCACTACAAATTTCATCGCAATTTAATTCCCCCAATTAATTATCCACAGAAAAATGATGAAAGAGAGAGCTGACTTTGGCAAAAAGTCACATTTCAGATCCTTTTAGAGAAAGGCCATTCCGGTTCTCGGCTAGGCGACAATGTCAGTGGTGAAATTTCTGTGTGTGTTGGTGGCGGCGGCGGCGGCAGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992324
ATGTCAGTGGTGAAATTTCTGTGTGTGTTGGTGGCGGCGGCGGCGGCAGCGGAGGCGGCGGCAGTGGCCGGGACTGCGCCGTACAGAATCCACACGCTTTTCTCGGTTGAGTGCCAGAATTACTTCGATTGGCAGACGGTGGGCCTCATGCACAGCTTCCGCAAAGCCAGGCAGCCCGGCCCGATCACCAGGCTGCTGAGTTGCACTGAGAAAGAAAGGAAGAATTATAAAGGCATGGACTTGGCGCCCACGTTTGAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772895.1
MSVVKFLCVLVAAAAAAEAAAVAGTAPYRIHTLFSVECQNYFDWQTVGLMHSFRKARQPGPITRLLSCTEKERKNYKGMDLAPTFEVPSMSLHPKTGDWYPAINKPAGVVHWLKHSKEAENVDWVVILDADMIVRGPILPWELGAEKGRPVAAYYGYLIGCDNILAKLHTKHPELCDKVGGLLAFHIDDLRVFAPMWLSKTEEVRADKAHWATNITGDIYGTGWISEMYGYSFGAAEVGLRHKINENLMIYPGYVPREGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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