当前解析结果
SmilChr07G001151| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001151 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001151 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G001151 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 8638711 - 8640583 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992328 |
|---|---|
| GeneID | 130992328 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992328 |
| 原始查询 | SmilChr07G001151 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | tail fiber [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830998]; symbol=AT5G11280; hit=AT5G11280; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | tail fiber [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830998]; symbol=AT5G11280; hit=AT5G11280; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G11280 (AT5G11280)tail fiber [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830998] identity=39.8; qcov=1.02; evalue=4.18e-44; confidence=medium |
| Rice | Os01g0555300- identity=36; qcov=1.01; evalue=3.14e-43; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992328 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057772900.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.40000 | XP_057772900.1 |
| 3 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.20000 | XP_057772900.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057772900.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057772900.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:8638979 |
A |
ATT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 4 | B29,B37,C24,C51 |
Chr7:8638979 |
A |
ATT |
2bp_insertion | CDS_variant | 4 | B29,B37,C24,C51 |
Chr7:8639827 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr7:8639876 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B35,B67,C53,C9 |
Chr7:8639893 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C31 |
Chr7:8639963 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B121,B37,B9 |
Chr7:8640131 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C5 |
Chr7:8640240 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B78,B82,C33,C4,C46 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。