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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001161`

染色体: Chr07 坐标: 8684881-8689728 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001161`
名称	SmilChr07G001161
描述	periodic tryptophan protein 2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8684881 - 8689728 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992336`
GeneID	`130992336`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992336`
原始查询	`SmilChr07G001161`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	periodic tryptophan protein 2
产物	periodic tryptophan protein 2
Arabidopsis	`AT1G15440` (PWP2) periodic tryptophan protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838115] identity=70.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0519500` (OsWD40-120) - identity=70.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000028 (ribosomal small subunit assembly); GO:0000462 (maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0005515 (protein binding); GO:0032040 (small-subunit processome); GO:0034388 (Pwp2p-containing subcomplex of 90S preribosome)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00400 (WD40); PF04003 (Utp12); PF12894 (ANAPC4_WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992336

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772914.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057772914.1`
3	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.60000	`XP_057772914.1`
4	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.40000	`XP_057772914.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057772914.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8687376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr7:8687919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B124,B128,B29
`Chr7:8687956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B12
`Chr7:8688015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C46
`Chr7:8688087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr7:8688124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:8688532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B62,B87,C20
`Chr7:8688544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B17,B6,C21,C67
`Chr7:8688616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B86
`Chr7:8688721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:8688777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr7:8688956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772914.1

895 aa

448

895

WD40

ANAPC4_WD40

WD40

Utp12

PF00400 WD40 94-119 aa PF00400 WD40 132-166 aa PF00400 WD40 379-411 aa PF12894 ANAPC4_WD40 379-435 aa PF00400 WD40 418-454 aa PF00400 WD40 503-540 aa PF00400 WD40 552-582 aa PF04003 Utp12 785-890 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772914.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	94	119	9.1e-51	168.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057772914.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	132	166	9.1e-51	168.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057772914.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	379	411	9.1e-51	168.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057772914.1`	Pfam	`PF12894`	ANAPC4_WD40	Repeat	379	435	1.4e-22	80.5	Anaphase-promoting complex subunit 4 WD40 domain
`XP_057772914.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	418	454	9.1e-51	168.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057772914.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	503	540	9.1e-51	168.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057772914.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	552	582	9.1e-51	168.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057772914.1`	Pfam	`PF04003`	Utp12	Family	785	890	5.5e-26	91.5	Dip2/Utp12 Family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916931.1
ATTTTCGTTTTGACAACTTTCTTTTAAGACTTCAACTCGGGTTTCCGGGCTTCTTCAGCACGGGGTTTTAGGGTTTAAGTATCCATAAACCAACCCCTTCACCGCCAAAACCCTAAACACACTTTCGTCATGAATTACAGGTTCCAGAATTTATTAGGCGCGCCGTATCGCGGCGGGAACGCCGCCGTCGTCAACAACACTCTGTTAGTCTCGCCTGTCGGCAACCGCGTCTCCGTCACCGACCTTATCAAGTCCGAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992336
ATGAATTACAGGTTCCAGAATTTATTAGGCGCGCCGTATCGCGGCGGGAACGCCGCCGTCGTCAACAACACTCTGTTAGTCTCGCCTGTCGGCAACCGCGTCTCCGTCACCGACCTTATCAAGTCCGAGACCATAACCCTTCCCTGCCAGGCCTCCACCAATCTCCGCCGCATCGCCGCCTCACCAGACGGCGTGTTCCTCCTCACCGTCGACGAGAACAACCGCTGTTTGTTCATAAACCTCCCTCGCCGCGCCGTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772914.1
MNYRFQNLLGAPYRGGNAAVVNNTLLVSPVGNRVSVTDLIKSETITLPCQASTNLRRIAASPDGVFLLTVDENNRCLFINLPRRAVLHRLSFKHPVADVKFSPDGRLIAVAAGKLLQVWRSPGFRKEFFPFELIKTFSDCNDRITSLDWSPSSDYLVVGSKDLTGRLFYLSKGKKKKNSYTKPFLFLGHRDTIVGTFFGVDKKTNDVTNVYTLSRDGAIFTWGCSSNDPEPNHMEEDSSEPDSPGTPEQRQNGEESDGVN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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