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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001163`

染色体: Chr07 坐标: 8707822-8710595 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001163`
名称	SmilChr07G001163
描述	uncharacterized SmilChr07G001163
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8707822 - 8710595 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992338`
GeneID	`130992338`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992338`
原始查询	`SmilChr07G001163`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-directed RNA polymerase III subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828101]; symbol=AT4G01590; hit=AT4G01590; species=arabidopsis; confidence=low
产物	DNA-directed RNA polymerase III subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828101]; symbol=AT4G01590; hit=AT4G01590; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G01590` (AT4G01590) DNA-directed RNA polymerase III subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828101] identity=39.7; qcov=0.578; evalue=7.2e-09; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0005666 (RNA polymerase III complex); GO:0006383 (transcription by RNA polymerase III)
KEGG	smil03020 (RNA polymerase - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992338

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772916.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057772916.1`
3	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057772917.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057772916.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772918.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8708116`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B126,B136,B32,B69,B73,B75,C42
`Chr7:8708117`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A14,A20,A4,B103,B109,B17,B36,B77,C11,C13,C43,C63,C69,C7,C75,C82,C86,D10,D11
`Chr7:8708197`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	31	B102,B119,B123,B13,B40,B42,B43,B47,B49,B50,B65,B66,B70,B72,B79,B94,C17,C20,C22,C31,C36,C41,C43,C47,C52,C55,C64,C66,D2,D3,D8
`Chr7:8709949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr7:8709953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B4,C39
`Chr7:8710002`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A15
`Chr7:8710002`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A15

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916934.1
AAAAACAAAGAAAAGAAATTAGAAATTGCCGTCTATCTGCCGCTTTCTCTCTGGCGTTTTCACTCTCTCTCTGCATTGCGCTGGTTGCCGCCGCCCCAGCATCCTCCGGTGGCCCGTGGCTGCGGCCTCGCCGCCTCGTACCTCTCCGTCCAAGCGCTGCGACCTGCAAGCGCCAAGCAGCCAGCACAGCCCCAGTGCGCCGCCAACTCTCGCCGGCTCGCCCTGCTCCGTCTCCTTCGATCGACAGCAAAGTGCGCGAC...

XM_057916933.1
CAAAGAAAAGAAATTAGAAATTGCCGTCTATCTGCCGCTTTCTCTCTGGCGTTTTCACTCTCTCTCTGCATTGCGCTGGTTGCCGCCGCCCCAGCATCCTCCGGTGGCCCGTGGCTGCGGCCTCGCCGCCTCGTACCTCTCCGTCCAAGCGCTGCGACCTGCAAGCGCCAAGCAGCCAGCACAGCCCCAGTGCGCCGCCAACTCTCGCCGGCTCGCCCTGCTCCGTCTCCTTCGATCGACAGCAAAGTGCGCGACTGCGC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130992338
ATGGCATTCAGAGGAGGGGGCCGCGGCGGCCGTGGCCGAGGCCGTGGGCCGCCTAGGGCGAAGGAAGTACCTTTCGATTATTTTCCGGAAATCGAGTGTTTAGGAGCTGTGAATTACACTAAGGAAGAAGTAAGAAAGTATTCTCAGTTTGTGAATTGGTCACAGAATCTGCAGACCTTTTTCGAGACATCTCCTTACTATTACGAAGATCAAAGCTCCCTTCAGAAAGTGCAAAAACTGGACATAGAAAGGTACTCAGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057772916.1
MAFRGGGRGGRGRGRGPPRAKEVPFDYFPEIECLGAVNYTKEEVRKYSQFVNWSQNLQTFFETSPYYYEDQSSLQKVQKLDIERYSDKKSQATIVKQPLWHLIMMDKDHMPAELARGEKRIVRRVQWDNDIDLNKLDHFEKLEANSKGKEGEDEEEEPEEEENVEEGELSDNGDYEQGEYCDDDEDDFNMVEEDGMLDLARAFFSFLTSSESFIHIYVSFDLSAYELAMFADEPIY

XP_057772917.1
MAFRGGGRGGRGRGRGPPRAKEVPFDYFPEIECLGAVNYTKEEVRKYSQFVNWSQNLQTFFETSPYYYEDQSSLQKVQKLDIERYSDKKSQATIVKQPLWHLIMMDKDHMPAELARGEKRIVRRVQWDNDIDLNKLDHFEKLEANSKGKEGEDEEEEPEEEENVEEGELSDNGDYEQGEYCDDDEDDFNMVEEDDEPIY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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