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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001166`

染色体: Chr07 坐标: 8724721-8730039 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001166`
名称	SmilChr07G001166
描述	(6-4)DNA photolyase
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8724721 - 8730039 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992342`
GeneID	`130992342`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992342`
原始查询	`SmilChr07G001166`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	(6-4)DNA photolyase
产物	(6-4)DNA photolyase
Arabidopsis	`AT3G15620` (UVR3) DNA photolyase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820804] identity=73.6; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0204400` (UVR3) - identity=69.2; qcov=0.907; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0032922 (circadian regulation of gene expression); GO:0043153 (entrainment of circadian clock by photoperiod); GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF00875 (DNA_photolyase); PF03441 (FAD_binding_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992342

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057772927.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057772927.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057772927.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772927.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772927.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8724990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr7:8724992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr7:8725032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr7:8727581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C46
`Chr7:8727750`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr7:8727793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr7:8728292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,D7
`Chr7:8729247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:8729530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772927.1

551 aa

276

551

DNA_photolyase

FAD_binding_7

PF00875 DNA_photolyase 22-182 aa PF03441 FAD_binding_7 311-507 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772927.1`	Pfam	`PF00875`	DNA_photolyase	Domain	22	182	1.2e-43	149.7	DNA photolyase
`XP_057772927.1`	Pfam	`PF03441`	FAD_binding_7	Domain	311	507	1.3e-74	250.7	FAD binding domain of DNA photolyase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916944.1
GAAAAATAAAAATCAAATGGTCTAATACACAATTCATCTTGGATTATGGAATAAGTATTCGGGAAAATTGTATAGTTTGCTTTGTATTCGGGAAAAAAAGACTTTTCTTGAACTGAGTGAAATTTTCACGTTTGTACAGAAATAATGGAACATGTTTAAATTTTACCCTATTTTATTAACCATACTCCTTCATCCTTTTTTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAAATCTACTTCTAAGATGCATTAATAAAGAGCTAGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992342
ATGCGCCTCCCCACTATCCCGCTCCGCTCGCCCCCGTACCCGACAATGGCATCCGGGTCGAACTCCCTGATTTGGTTCAGGAAAGGGCTCCGGATTCACGACAACCCGGCGCTGGAGTACGCGGTCAGTGGGTCGAGTGTTTTGTACCCGGTTTTCGTGATCGACCCGCACTACATGGAGCCCGAACCAAGCGCTTTCTCCCCCGGGTCTATCCGGGCCGGGTTGAACCGGATCAGGTTCCTGCTCGAGAGTCTGGCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772927.1
MRLPTIPLRSPPYPTMASGSNSLIWFRKGLRIHDNPALEYAVSGSSVLYPVFVIDPHYMEPEPSAFSPGSIRAGLNRIRFLLESLADLDLNLKRLGSRLLVLKGEPSEVLFRCLNEWSIKKLCFEFDTEPYYQALDDKVKKYATAAGIEIYSPVSHTLFNPADIIEKNGGKPPSTYQSFVKLAGEPSWASSPLVTDLNWLPVVGNVGKCPITEVPSIKELGYEDTPEDEKTPFKGGESEGLRRLKASVENKEWVANFEKP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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