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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001168`

染色体: Chr07 坐标: 8786076-8786826 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001168`
名称	SmilChr07G001168
描述	uncharacterized SmilChr07G001168
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8786076 - 8786826 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993782`
GeneID	`130993782`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993782`
原始查询	`SmilChr07G001168`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G42860` (AT3G42860) zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823332] identity=36.5; qcov=0.493; evalue=5.38e-06; confidence=low
Rice	`Os11g0256300` - identity=37.3; qcov=0.447; evalue=9.57e-11; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF06839 (Zn_ribbon_GRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993782

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057774802.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057774802.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057774802.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774802.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774802.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8786271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:8786279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B24,C51
`Chr7:8786312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B84
`Chr7:8786313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr7:8786315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B41
`Chr7:8786324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr7:8786329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,D3
`Chr7:8786342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr7:8786352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr7:8786506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B30,B76
`Chr7:8786530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B56
`Chr7:8786550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B80,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774802.1

150 aa

150

Zn_ribbon_GRF

PF06839 Zn_ribbon_GRF 40-75 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774802.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	40	75	1.5e-09	38.5	GRF zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918819.1
CTTGTAACTACCCGAAATCCCCCTTTTTATTTGGGGAATATGTTTGCGTTCGAAGAACCCTAGCCGGCGATGATTTGTTGCAAATTCCCGATCATCTTTCGGGTTTTCCTGAAATTAGAATAGGGTTTCTTCGTGTTGTTGGACTGCGTTTTTAGCCATGAGTCTGAATTCCGTCTCTGGTGGTTATGGATCGAGCACATCGCGCGGTGGACGTCAGTTTGAAGATAATCAAAATCCCAGGCGTTGTACGTGCGAAATTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993782
ATGAGTCTGAATTCCGTCTCTGGTGGTTATGGATCGAGCACATCGCGCGGTGGACGTCAGTTTGAAGATAATCAAAATCCCAGGCGTTGTACGTGCGAAATTGACGGTAGAAGGTTGAGGGCTGTGATAATGACATCGTGGACTGACGAAAACCCCGGTAGGAGGTTTTATGGATGTCGAAATTGGAAGACGAAGAACTGCGGTTTTTTTGATTGGCTTGACGAACCAATTAGCGAAAGAGGCAAGGAAGTTATCAATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774802.1
MSLNSVSGGYGSSTSRGGRQFEDNQNPRRCTCEIDGRRLRAVIMTSWTDENPGRRFYGCRNWKTKNCGFFDWLDEPISERGKEVINELKLMKIKDSSSSAPTDMEPEIVKLWDFVQALKSESSEIKKKVRLVTAMLVASWIMYPFVLEMK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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