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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001171`

染色体: Chr07 坐标: 8816103-8821307 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001171`
名称	SmilChr07G001171
描述	uncharacterized SmilChr07G001171
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8816103 - 8821307 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992348`
GeneID	`130992348`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992348`
原始查询	`SmilChr07G001171`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsWD40-130; symbol=OsWD40-130; hit=Os06g0598900; species=rice; confidence=high
产物	OsWD40-130; symbol=OsWD40-130; hit=Os06g0598900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G15610` (AT3G15610) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820803] identity=75.9; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0598900` (OsWD40-130) - identity=78.2; qcov=0.952; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000387 (spliceosomal snRNP assembly); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0032797 (SMN complex)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40); PF23381 (Beta-prop_IFT122_1st)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992348

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057772935.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057772935.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057772935.1`
4	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057772935.1`
5	Midbody	Midbody	0.40000	`XP_057772935.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8818056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr7:8819185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B93,C2,C48,D7
`Chr7:8820250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr7:8820259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B109,C11,C69,C75
`Chr7:8820862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr7:8820879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B82,B84,C25
`Chr7:8820990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:8821010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,C10,C31,C42
`Chr7:8821112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772935.1

356 aa

178

356

Beta-prop_IFT122_1st

WD40

PF23381 Beta-prop_IFT122_1st 19-298 aa PF00400 WD40 54-89 aa PF00400 WD40 95-130 aa PF00400 WD40 179-214 aa PF00400 WD40 266-297 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772935.1`	Pfam	`PF23381`	Beta-prop_IFT122_1st	Repeat	19	298	9.8e-40	137.3	IFT122 first beta-propeller
`XP_057772935.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	54	89	6.9e-35	118.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057772935.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	95	130	6.9e-35	118.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057772935.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	179	214	6.9e-35	118.7	WD domain, G-beta repeat
`XP_057772935.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	266	297	6.9e-35	118.7	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916952.1
GGAAAATATTTGGAAAATTGTGTATATAAATAAACTAGGGCACGTCTAACATTCTTGCGCCTAGCCCTATACCCCAGTTTTGCACCTATGGAATTGTTTCCATTTCCTTAGTAATTATTTTTGTAATATTTCTAATTTTTACCAAATTAACGAATAAATTTGATCTATCTAGGGTTAGGAGGTGTGGATCCGGCGCAGAATTTCAACCGATTACAATTTTTCAAAAGATTAGGGTTTCGCACCTGTGTTCATTGCCGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992348
ATGGATAAGAAGAAGGTTGTAGCCCCATTGGTCTGCCATGGGCATTCACGACCTGTTGTTGATTTGTTCTACAGTCCGGTAACGCCTGATGGGTTCTTCCTTGTTAGTGCAAGCAAGGACTCGACACCAATGTTGAGAAATGGAGAGACAGGAGATTGGATTGGGACCTTTCAAGGGCATAAAGGTGCAGTATGGAGCTGTTGCCTGGATAAACAAGCCCTGCGTGCGGCCTCTGCATCTGCTGATTTTTCTGCGAAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772935.1
MDKKKVVAPLVCHGHSRPVVDLFYSPVTPDGFFLVSASKDSTPMLRNGETGDWIGTFQGHKGAVWSCCLDKQALRAASASADFSAKLWDALTGDELHSFEHKHIVRACAFSEDTHLLLTGGMEKVVRIFDLNKPDAPPREIEKSPGSVRTISWLHSDQTILGSCTDMGGVRLWDVRTGTIVRTLDTKASVTSAEVSQDGRYITTADGTSVKFWDANHFGLVKSYEMPCIVESASMEPKYGNKFIAGGEDMWVHVFDFHTG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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