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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001173`

染色体: Chr07 坐标: 8866352-8868264 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001173`
名称	SmilChr07G001173
描述	caffeoylshikimate esterase
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	8866352 - 8868264 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992350`
GeneID	`130992350`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992350`
原始查询	`SmilChr07G001173`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	caffeoylshikimate esterase
产物	caffeoylshikimate esterase
Arabidopsis	`AT1G52760` (LysoPL2) lysophospholipase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841709] identity=78; qcov=0.934; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0207900` - identity=62.5; qcov=0.958; evalue=1.57e-136; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0016298 (lipase activity)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992350

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057772936.1`
2	Lipid droplet	脂滴	0.40000	`XP_057772936.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057772936.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057772936.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772936.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:8866579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,C10,C31,C42
`Chr7:8866891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr7:8866932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr7:8866988`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B21
`Chr7:8866988`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B21
`Chr7:8866991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr7:8867698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:8867910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B101,B48,C46,D11
`Chr7:8867925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B31,B82,B84,C25
`Chr7:8867928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B86
`Chr7:8868047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr7:8868101`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A16,B31,B84,C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772936.1

331 aa

166

331

Hydrolase_4

Abhydrolase_1

Abhydrolase_6

PF12146 Hydrolase_4 55-297 aa PF00561 Abhydrolase_1 59-175 aa PF12697 Abhydrolase_6 60-299 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772936.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	55	297	3.8e-51	174.4	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057772936.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	59	175	5.4e-08	33.5	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057772936.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	60	299	5.3e-08	34.5	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916953.1
ATATCATACGTATTTATTTGAGATCAACGTTTGGTGAAGTAGCGCTAATGATTAAAAGAAAAGAAATGCGGTGGACCCCACCACTCCCAACTACCCCCAAAATCCCCCCCAATTTAAACCACGGCACCCCCTCTCTTCCACCAACTCCCACCGCCAAAAATCAAAATGTCGCCGGAAAACCCCTCCGCCCCGCCCAATTTCTGGGGCGACACGCCGGAGGAGGAGTACTACGCTTCCCAGGGCGTCCGCAATTCGAAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992350
ATGTCGCCGGAAAACCCCTCCGCCCCGCCCAATTTCTGGGGCGACACGCCGGAGGAGGAGTACTACGCTTCCCAGGGCGTCCGCAATTCGAAATCCTACTTCGAATCCCCACACGGCAGGCTCTTCACCCAATCCTTCCTCCCCCTCGAACCGACCTGCCCCGTCAAGGGCTCCGTCTTCATGACCCACGGATACGGGTCCGACACCGGCTGGATGTTCCAGAAGTTCTGCATCAACTTCGCGAGCTGGGGCTACGCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772936.1
MSPENPSAPPNFWGDTPEEEYYASQGVRNSKSYFESPHGRLFTQSFLPLEPTCPVKGSVFMTHGYGSDTGWMFQKFCINFASWGYAVFAADMLGHGRSDGIRCYMGDLRKVAAASLSFFKSVRVSEDYKDLPAFLVGESMGGLATLLMYFQSEKDLWTGLIFSAPLFVIPEAMMPSKIHLLAYGMLFGLADTWAAMPDNKMVGKAIKDPEKLKVIASNPLRYTGKPRVGTMRELVRQTEYVQSNFDKVTVPFFTAHGTSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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