当前解析结果
SmilChr07G001204| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001204 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001204 |
| 描述 | protein CDI-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 9178733 - 9179759 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130992380 |
|---|---|
| GeneID | 130992380 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992380 |
| 原始查询 | SmilChr07G001204 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein CDI-like |
| 产物 | protein CDI-like |
| Arabidopsis | AT1G64980 (CDI)Nucleotide-diphospho-sugar transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842806] identity=72.1; qcov=0.985; evalue=5.03e-148; confidence=high |
| Rice | Os07g0413800- identity=66.8; qcov=0.863; evalue=7.06e-122; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992380 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057772968.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057772968.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057772968.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057772968.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057772968.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:9178984 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C51 |
Chr7:9179024 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A21,B93 |
Chr7:9179257 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B112 |
Chr7:9179496 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C39 |
Chr7:9179569 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A13 |
Chr7:9179732 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。