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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001216`

染色体: Chr07 坐标: 9289900-9297689 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001216`
名称	SmilChr07G001216
描述	uncharacterized SmilChr07G001216
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	9289900 - 9297689 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992391`
GeneID	`130992391`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992391`
原始查询	`SmilChr07G001216`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817312]; symbol=AT2G27660; hit=AT2G27660; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817312]; symbol=AT2G27660; hit=AT2G27660; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G27660` (AT2G27660) Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817312] identity=34.1; qcov=0.167; evalue=2.69e-22; confidence=weak
Rice	`Os12g0292200` - identity=45.7; qcov=0.089; evalue=3.51e-18; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03107 (C1_2); PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992391

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057772985.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057772985.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057772985.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772985.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772985.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:9292915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B3,B84,C77,C8
`Chr7:9292933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B3,B84,C1,C8
`Chr7:9292934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr7:9292936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr7:9292981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B95
`Chr7:9292985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B95
`Chr7:9293098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr7:9293119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr7:9293200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C45,C81
`Chr7:9293203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C45,C81
`Chr7:9293219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B13,B136
`Chr7:9293220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C45,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772985.1

1056 aa

528

1056

C1_2

Asp_protease_2

PF03107 C1_2 72-119 aa PF03107 C1_2 135-179 aa PF13650 Asp_protease_2 872-960 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772985.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	72	119	9.1e-29	100.2	C1 domain
`XP_057772985.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	135	179	9.1e-29	100.2	C1 domain
`XP_057772985.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	872	960	5e-07	31.1	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091283.1
TTTCCATCTCATATATAGCTCTCGATTTCTATTATATTTTTGTCTATCTTAATTGAATTGTGTGATTTCATGTTCCACTGATGCACACAAATCTCACAAGTCACAAATATTTGGCATGTAGTTAACTTTGTGATCTATTACTGCACTATAGATTGAATTATGGAGAAGGTTATTAATCATTTCTGTCATGAACATCCTTTATTTACTTGTAAACAAGATGAGGCGAGTTTAGATTGTTATGTGTGTGGTGATGTGGTAAG...

XM_057917002.1
ATCTAAATGTCTACACAATTTCCATCTCATATATAGCTCTCGATTTCTATTATATTTTTGTCTATCTTAATTGAATTGTGTGATTTCATGTTCCACTGATGCACACAAATCTCACAAGTCACAAATATTTGGCATGTAGTTAACTTTGTGATCTATTACTGCACTATAGATTGAATTATGGAGAAGGTTATTAATCATTTCTGTCATGAACATCCTTTATTTACTTGTAAACAAGATGAGGCGAGTTTAGATTGTTATGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992391
ATGGAGAAGGTTATTAATCATTTCTGTCATGAACATCCTTTATTTACTTGTAAACAAGATGAGGCGAGTTTAGATTGTTATGTGTGTGGTGATGTGGTAAGTAATTTGGAGTCGGCATATGCTTGCAAGCAACCTCAATGTAATAATAGCAGTAATAGTAGAATTATCCTCCATGAAAGATGTGGTGAGATGCCTAGTCGAATTTTTTCGCATCCCTCCCACCTTGAGCATCCTCTTCACCTATTTGATTATCGACATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772985.1
MEKVINHFCHEHPLFTCKQDEASLDCYVCGDVVSNLESAYACKQPQCNNSSNSRIILHERCGEMPSRIFSHPSHLEHPLHLFDYRHLSAGYFCNLCGATIGSKVGYRCPSCEFDIHIECCKLGVLIKERVEVQHPSHVHPLTLMRKNAFQFSCDGCGTQDMDMAYICSTCEYWVHATCASLPLLLPQHHHHHHLSLAFTFPMEHRKYRYMCDVCDKDFDMTCWLYFCGDCRYFAHLKCAATPTTNTPKQDHFLLGSSMAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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