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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001232`

染色体: Chr07 坐标: 9443706-9444920 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001232`
名称	SmilChr07G001232
描述	uncharacterized SmilChr07G001232
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	9443706 - 9444920 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993788`
GeneID	`130993788`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993788`
原始查询	`SmilChr07G001232`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=42.7; qcov=0.723; evalue=8.34e-41; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=36.7; qcov=1.22; evalue=8.5e-64; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993788

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774808.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057774808.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774808.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774808.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774808.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:9443719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr7:9443722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B87
`Chr7:9443729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C32,C68
`Chr7:9443779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B87
`Chr7:9443790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:9443814`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B46
`Chr7:9443841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:9443853`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,C36,C83
`Chr7:9443875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B46
`Chr7:9443881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr7:9443893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	B102,B138,B22,B25,B31,B50,B57,B89,C16,C44,C58,C6,C60,C71,D3
`Chr7:9443902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B131,C23,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774808.1

314 aa

157

314

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 29-68 aa PF04827 Plant_tran 128-254 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774808.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	29	68	1.1e-15	57.8	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057774808.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	128	254	2.5e-47	161.9	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918825.1
ATGAAAGTTGCTAGTGCTTATCGATTTGATCCTTCGCCTCTACCGGAGAGGAAGCGACGATTTATTCATTGTGATCGTGAAGGTGGTGGCGACCGCCTTTATCGGGATTATTTTGCTCCCGAACCGGTGTGCGGCCCTCACCTATTTCGGCGTCGTTTTCGCACGAGGCGGGAGTTACTTCTACGCATCGTGAATGTGCTAGAAATCGATCATTTTTTCCAACAACGTCCCGATGCGGTTGGTCGCTTTGGCTTCTCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993788
ATGAAAGTTGCTAGTGCTTATCGATTTGATCCTTCGCCTCTACCGGAGAGGAAGCGACGATTTATTCATTGTGATCGTGAAGGTGGTGGCGACCGCCTTTATCGGGATTATTTTGCTCCCGAACCGGTGTGCGGCCCTCACCTATTTCGGCGTCGTTTTCGCACGAGGCGGGAGTTACTTCTACGCATCGTGAATGTGCTAGAAATCGATCATTTTTTCCAACAACGTCCCGATGCGGTTGGTCGCTTTGGCTTCTCGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774808.1
MKVASAYRFDPSPLPERKRRFIHCDREGGGDRLYRDYFAPEPVCGPHLFRRRFRTRRELLLRIVNVLEIDHFFQQRPDAVGRFGFSPIQKYTAALRQLAYGTSADCCDEYLRIGESTVLSCLKKFCKAGEPTIILEAIASQDLWIWHAFFGVAGSNNDINVLNQSTLFNDVLLGNESAVHFVANNFHHTRGYYLTDGIYPNWSVFVKSFTYSGDKKKRRFKLMLEAARKDVERAFGVLQARWDIIKGGIAADWDGDADGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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