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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001236`

染色体: Chr07 坐标: 9459991-9463918 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001236`
名称	SmilChr07G001236
描述	probable sulfate transporter 3.4
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	9459991 - 9463918 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992413`
GeneID	`130992413`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992413`
原始查询	`SmilChr07G001236`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable sulfate transporter 3.4
产物	probable sulfate transporter 3.4
Arabidopsis	`AT3G15990` (SULTR3;4) sulfate transporter 3;4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820844] identity=75.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0143700` (OsSultr3) - identity=68.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008271 (secondary active sulfate transmembrane transporter activity); GO:0008272 (GO:0008272); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00916 (Sulfate_transp); PF01740 (STAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992413

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057773021.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057773021.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057773021.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773021.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773021.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:9460274`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr7:9460436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr7:9460461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:9460833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B42,B43
`Chr7:9460871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr7:9460872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr7:9461029`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	39	A24,A7,B100,B105,B11,B112,B113,B123,B140,B23,B32,B33,B37,B41,B42,B43,B49,B55,B58,B73,B79,B84,B89,B91,C16,C24,C3,C33,C48,C5,C51,C52,C58,C72,C74,C78,C80,C86,D5
`Chr7:9461041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:9461138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,C10,C42
`Chr7:9461154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B2,B32,B91,C86
`Chr7:9461168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr7:9461216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773021.1

661 aa

330

661

Sulfate_transp

STAS

PF00916 Sulfate_transp 99-478 aa PF01740 STAS 532-649 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773021.1`	Pfam	`PF00916`	Sulfate_transp	Family	99	478	4.6e-134	447.7	Sulfate permease family
`XP_057773021.1`	Pfam	`PF01740`	STAS	Domain	532	649	5.1e-23	81.6	STAS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917038.1
TAATAGTTTGGGTGGAAAATGGTAACTTGTGGTAGTATTTGAAAGAGTGAAGGTTCATGCAGAATCTGGGGGTTCTATAAAAAGGGTAAGCAGTCCTCACAAAACATCTCATCCACCACCTTCACTAATCGCAACTTCAACTGAGCACAACCATACCACCCCCGCCTCCGCCCCAAATCACCGCGGTGGTTTGCCTACATCTCCTAGACCAGTGCGAAAATGGGCATAAACTCGAACAGGGTCGATAACTTTTCAGACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992413
ATGGGCATAAACTCGAACAGGGTCGATAACTTTTCAGACCACGAAGCCCCGCCGCCGCCGGGCCTCCTCGAAGCTACAAACGCAATGCAAATGCCGTCGTTGGAGGTCCACAGAGTCTGCCTGCCGCCGCTCAGAACCACCGCGCAGAAGCTCCGCCACCGCCTCTCCGAGATCTTCTTCCCCGACGATCCGCTCCACAAGTTCAAGGACCAGACGTGGCTTCGCAGGCTCGTTTTGGGGCTGCAGTTTTTCTTCCCAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773021.1
MGINSNRVDNFSDHEAPPPPGLLEATNAMQMPSLEVHRVCLPPLRTTAQKLRHRLSEIFFPDDPLHKFKDQTWLRRLVLGLQFFFPIFQWAPNYSFKLFKSDVVSGVTIASLAIPQGISYAKLANLPPIIGLYSSFVPPLIYSVLGSSRHLAVGPVSIASLVMGTMLSETVSYNDEPILYLKLAFTATFFAGVFQASLGFLRLGFVIDFLSKATLVGFMAGAAVIVSLQQLKGLLGIVHFTTKMQLVPVLSSAFHQIDEW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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