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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001238`

染色体: Chr07 坐标: 9490482-9493973 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001238`
名称	SmilChr07G001238
描述	nuclear pore complex protein NUP50A-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	9490482 - 9493973 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992415`
GeneID	`130992415`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992415`
原始查询	`SmilChr07G001238`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear pore complex protein NUP50A-like
产物	nuclear pore complex protein NUP50A-like
Arabidopsis	`AT1G52380` (AT1G52380) NUP50 (Nucleoporin 50 kDa) protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841668] identity=51.1; qcov=1.04; evalue=1.34e-130; confidence=high
Rice	`Os05g0349500` - identity=42.2; qcov=1.14; evalue=1.25e-96; confidence=medium
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0005643 (nuclear pore); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0046907 (intracellular transport)
KEGG	-
Pfam	PF00638 (Ran_BP1); PF08911 (NUP50)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992415

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773024.1`
2	Nuclear pore complex	核孔复合体	0.60000	`XP_057773024.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.60000	`XP_057773024.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057773024.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773024.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:9492452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr7:9492756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B131,C12
`Chr7:9492761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,C32,C68
`Chr7:9492876`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,C32,C68
`Chr7:9492914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:9492915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr7:9493278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:9493537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773024.1

431 aa

216

431

NUP50

Ran_BP1

PF08911 NUP50 11-77 aa PF00638 Ran_BP1 297-413 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773024.1`	Pfam	`PF08911`	NUP50	Domain	11	77	4e-18	66.4	NUP50 (Nucleoporin 50 kDa)
`XP_057773024.1`	Pfam	`PF00638`	Ran_BP1	Domain	297	413	2.5e-17	64.0	RanBP1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917041.1
GGGGATGCACTAACCCATTGTAGCCCCTTCTCTCTCTCGCGCTCTCAGTCTCTCTCTTGAATGCACGCATTGGGCTAGGGTTTTAGCAGATCCGAAAAACATTCGACAGCCAAAACGTCAAGTTTTAATTGAGAGCATAGCCAAGCCCTTGTCCGAGGGGCTGCTGTGTTCCAGTGGACTGAATAAAAACCAAACACTACTCTGGTTTTTGCCTTTTTACTACCAATGGGGGATGCAGAAAACCTTCAACCATCTAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992415
ATGGGGGATGCAGAAAACCTTCAACCATCTAAAAAGAGAGCTGCTGGAGTCCAACTATCTCGTGATAACCCTGGTCTGGATGACGATGAACCGGAACAAGAGGCAGGAACTTTTAAGAAAGCAAGTGATGATGTTTTGGCCAAAAGAAGAATAGTGAAAGTACGTCGCCCTCAGATGTCAACTCCAGCTGCCCCACCTCCATCTGCTTCTAATCCTTTTGCTGCCATCCAGTTGGTACCGCTTACTTCATCTGCTCCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773024.1
MGDAENLQPSKKRAAGVQLSRDNPGLDDDEPEQEAGTFKKASDDVLAKRRIVKVRRPQMSTPAAPPPSASNPFAAIQLVPLTSSAPSQVEAHSGQSKETEQIDESKSENKVDEPSRDESIKEEKSDVNDDNTKQSENKVDDSNAQPDDNVVVQEKDNSVVEEVVVSGNGGDEATIPTEADTVETQTGKDEKDNGDDKEKENEATAEKNEEAVPFSSFRQLSSNQNAFSGLTGTGFSSPSFSFGSINKDGTAPKSDSTTTF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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