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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001250`

染色体: Chr07 坐标: 9634170-9646590 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001250`
名称	SmilChr07G001250
描述	purine permease 3-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	9634170 - 9646590 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992425`
GeneID	`130992425`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992425`
原始查询	`SmilChr07G001250`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	purine permease 3-like
产物	purine permease 3-like
Arabidopsis	`AT1G28220` (PUP3) purine permease 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839716] identity=59.1; qcov=0.912; evalue=5.23e-147; confidence=high
Rice	`Os09g0467400` (OsPUP3) - identity=60.1; qcov=0.887; evalue=1.56e-134; confidence=high
GO	GO:0015211 (purine nucleoside transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00892 (EamA); PF16913 (PUNUT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992425

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057773032.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057773032.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057773032.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773032.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773032.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:9634323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C1
`Chr7:9634323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:9634500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B140,B24,C80
`Chr7:9634616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B5,C15
`Chr7:9645757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:9645899`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B25
`Chr7:9645899`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B25
`Chr7:9645902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr7:9646025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B71
`Chr7:9646204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C15
`Chr7:9646284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr7:9646361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773032.1

362 aa

181

362

PUNUT

EamA

PF16913 PUNUT 16-333 aa PF00892 EamA 63-156 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773032.1`	Pfam	`PF16913`	PUNUT	Family	16	333	2.4e-113	379.3	Purine nucleobase transmembrane transport
`XP_057773032.1`	Pfam	`PF00892`	EamA	Domain	63	156	1.4e-06	29.4	EamA-like transporter family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917049.1
TAGAAAACCTCTATACTACAATTGTCCGAGTCTCCAGATCCCCGAGATTGAGGTAATCATTCAACAGGAAAATATATTTCCCCTATAAAAAGGGAGAATTATTAACGGAAAAGAAAGTAAACAAACTGCAGTATTTATAAAATGGAAGAGAACCAAAGCAGCAGCGCCGCCGCCATGAAAAAGGTTTATCTGATAATCAACTGCCTCATACTCGCCGTCGGCAACTGCGGCGGGCCCCTCATCATGCGCCTCTACTTCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992425
ATGGAAGAGAACCAAAGCAGCAGCGCCGCCGCCATGAAAAAGGTTTATCTGATAATCAACTGCCTCATACTCGCCGTCGGCAACTGCGGCGGGCCCCTCATCATGCGCCTCTACTTCGTCCGCGGCGGCAAGCGGATCTGGTTCTCCAGCTGGCTCGAGACCGGCGGCTGGCCCGTCACCCTCATCCCGCTCCTCGTGGCCTACACGCGCCGCCGCGGCACGGATACGCGGCTCTTCTTCATGCGGCCGCGCGTGTTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773032.1
MEENQSSSAAAMKKVYLIINCLILAVGNCGGPLIMRLYFVRGGKRIWFSSWLETGGWPVTLIPLLVAYTRRRGTDTRLFFMRPRVFAAAAVIGTMTGLDDYMFAYGVARLPVSTSSLLIATQLAFTAAFAFVLVRQRFTAYTVNSVVLLTLGAVVLGLHTSGDRPEGESNREYLMGFFLTLLAAGLYGLILPLIELTYKRANQPLTYTLVMEIQLVMCFFATAFCTVGMIVNKDFQAISREAKAFELGETRYYVVAVCSA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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