当前解析结果
SmilChr07G001272| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001272 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001272 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G001272 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 9776753 - 9779194 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992443 |
|---|---|
| GeneID | 130992443 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992443 |
| 原始查询 | SmilChr07G001272 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os02g0266300; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os02g0266300; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT3G24530 (AT3G24530)AAA-type ATPase family protein / ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822048] identity=32.2; qcov=1.01; evalue=6.53e-35; confidence=low |
| Rice | Os02g0266300- identity=34.3; qcov=0.915; evalue=1.18e-35; confidence=low |
| GO | GO:0005524 (ATP binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF29043 (DUF8495) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992443 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057773053.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057773053.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057773053.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773053.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057773053.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:9778604 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr7:9778667 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A13,B56,B96,C31,D7 |
Chr7:9778752 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C47 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057773053.1PF29043
DUF8495 173-259 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057773053.1 |
Pfam | PF29043 |
DUF8495 | Domain | 173 | 259 | 1.1e-18 | 68.0 | Domain of unknown function (DUF8495) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。