当前解析结果
SmilChr07G001277| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001277 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001277 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G001277 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 9814983 - 9817746 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130992448 |
|---|---|
| GeneID | 130992448 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992448 |
| 原始查询 | SmilChr07G001277 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0163300; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os06g0163300; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT1G45688 (AT1G45688)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841102] identity=41.9; qcov=1.1; evalue=4.82e-74; confidence=medium |
| Rice | Os06g0163300- identity=57.2; qcov=1.02; evalue=2.92e-124; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992448 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057773066.1 |
| 2 | Vacuole | 液泡 | 0.20000 | XP_057773066.1 |
| 3 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 0.20000 | XP_057773066.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057773066.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057773066.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:9815266 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C2 |
Chr7:9815303 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B34 |
Chr7:9815321 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A25,B10,B130,C18,D1 |
Chr7:9815395 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A15,B16,B95,C29,C54 |
Chr7:9815456 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B53,B77,C62 |
Chr7:9815718 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B44 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。