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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001279`

染色体: Chr07 坐标: 9841367-9842270 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001279`
名称	SmilChr07G001279
描述	dynein light chain 1, cytoplasmic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	9841367 - 9842270 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992451`
GeneID	`130992451`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992451`
原始查询	`SmilChr07G001279`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dynein light chain 1, cytoplasmic
产物	dynein light chain 1%2C cytoplasmic
Arabidopsis	`AT1G52245` (AT1G52245) dynein light chain LC6, flagellar outer arm-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717345] identity=84.8; qcov=1; evalue=7.33e-57; confidence=high
Rice	`Os02g0269200` - identity=70.8; qcov=0.967; evalue=1.23e-43; confidence=medium
GO	GO:0007017 (microtubule-based process); GO:0030286 (dynein complex); GO:0045505 (dynein intermediate chain binding); GO:0051959 (dynein light intermediate chain binding)
KEGG	smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04517 (IgSF CAM signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04814 (Motor proteins - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01221 (Dynein_light)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992451

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773072.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057773072.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057773072.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057773072.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057773072.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:9841947`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B36
`Chr7:9841947`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B36
`Chr7:9841991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773072.1

92 aa

Dynein_light

PF01221 Dynein_light 5-89 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773072.1`	Pfam	`PF01221`	Dynein_light	Domain	5	89	2.2e-33	115.2	Dynein light chain type 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917089.1
ATCGTTATCCTCTTTGATAGATGACGCCAGAAAAGAGTGTCCTCGAATAGAATAAGGCAAGAAAAGTCCTTAAAGTGAGTAGAAAAAGGACACTAAAAATAATTGGAAAATGTGCCAAATCACTCCACTACACATGGAGATCGCCCATATCCCACACATATTATACATACCATGCTTACAAGGCTTTGAGTTGAGTGGATTAACACCATCTCATTTCTTCAATCCTCTTCACTTTTCTGCCCTGAGAAAATAGGAGAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992451
ATGTTAGAAGGGAAAGCTTTGATAGAAGACACAGATATGCCACTGAAGATGCAGATCCAAGCAATGGCCTCTGCTTCTCAGGCTTTGGATCTCTACGATGTTCTTGACTGCAAATCCATAGCTGCCCACATCAAGAAGGAGTTTGACAAGAAGTATGGGAGTGGATGGCAGTGTGTGGTGGGATCCAACTTTGGGTGCTTTTTCACTCACTCCAAAGGGAGCTTCATATATTTCACACTAGAGACTCTCAACTTCCTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773072.1
MLEGKALIEDTDMPLKMQIQAMASASQALDLYDVLDCKSIAAHIKKEFDKKYGSGWQCVVGSNFGCFFTHSKGSFIYFTLETLNFLIFKGAS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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