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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001291`

染色体: Chr07 坐标: 9928574-9930170 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001291`
名称	SmilChr07G001291
描述	uncharacterized SmilChr07G001291
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	9928574 - 9930170 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993801`
GeneID	`130993801`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993801`
原始查询	`SmilChr07G001291`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0482100; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0482100; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G06220` (AT5G06220) LETM1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830509] identity=24.1; qcov=0.959; evalue=5.58e-17; confidence=weak
Rice	`Os08g0482100` - identity=26; qcov=0.891; evalue=1.08e-23; confidence=low
GO	GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0030003 (intracellular monoatomic cation homeostasis)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993801

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774819.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057774819.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774819.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774819.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774819.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:9928648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr7:9928738`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	64	A20,A7,B102,B104,B109,B119,B123,B124,B130,B134,B22,B25,B27,B28,B29,B30,B34,B40,B41,B45,B49,B50,B57,B59,B66,B7,B70,B76,B79,B8,B83,B89,B94,C11,C16,C17,C2,C32,C36,C39,C40,C42,C43,C44,C52,C55,C58,C59,C6,C64,C66,C68,C69,C71,C75,C81,C83,C84,C86,D10,D11,D2,D3,D8
`Chr7:9928740`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	64	A20,A7,B102,B104,B109,B119,B123,B124,B130,B134,B22,B25,B27,B28,B29,B30,B34,B40,B41,B45,B49,B50,B57,B59,B66,B7,B70,B76,B79,B8,B83,B89,B94,C11,C16,C17,C2,C32,C36,C39,C40,C42,C43,C44,C52,C55,C58,C59,C6,C64,C66,C68,C69,C71,C75,C81,C83,C84,C86,D10,D11,D2,D3,D8
`Chr7:9928751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr7:9929033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:9929069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr7:9929073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B101,C25
`Chr7:9929198`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	50	A19,A22,A4,B102,B104,B114,B115,B119,B12,B127,B129,B135,B19,B22,B24,B25,B26,B32,B41,B50,B54,B57,B60,B62,B64,B73,B89,B9,B94,B99,C1,C16,C19,C22,C3,C42,C44,C51,C57,C58,C6,C71,C74,C80,D1,D11,D3,D6,D8,D9
`Chr7:9929204`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C42
`Chr7:9929204`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C42
`Chr7:9929226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,C72,C73
`Chr7:9929326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918836.1
ATGGCCCACCATTGCAGTTTCTCCATGGAGCTTCTTCACAAGCATTTCAGTCGAAATGGATCCCTCCCAGAGCAGTATCTCAGATGGCATCCGTGTCTGGCTCTAGTTTTGAGGATGATTGTTCTGTGTTCGAAACTCAATGTAGCCAAGCGGAGTTCAATCGCGTTAGATTATCTTGTTCGGGTGCTACATGAATCTTCTAGAAGCTTCTCCCTTGCAATGCAGACTCTTGAATTGGCTAGAACCGGATCACCACTTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993801
ATGGCCCACCATTGCAGTTTCTCCATGGAGCTTCTTCACAAGCATTTCAGTCGAAATGGATCCCTCCCAGAGCAGTATCTCAGATGGCATCCGTGTCTGGCTCTAGTTTTGAGGATGATTGTTCTGTGTTCGAAACTCAATGTAGCCAAGCGGAGTTCAATCGCGTTAGATTATCTTGTTCGGGTGCTACATGAATCTTCTAGAAGCTTCTCCCTTGCAATGCAGACTCTTGAATTGGCTAGAACCGGATCACCACTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774819.1
MAHHCSFSMELLHKHFSRNGSLPEQYLRWHPCLALVLRMIVLCSKLNVAKRSSIALDYLVRVLHESSRSFSLAMQTLELARTGSPLAMAWNGVDVHAWHKHIAYQAAAYALLKAAMEVELFLSHNRSNNSPVNEIFPFICSSGYEELAYVMTFISLMFASLSPSIDLLQGRIESQLNTRDPKLVQWFRVVELPRIDGCFMPLFKKWSAEYAGSTRKLSRNLTHKLLSGIAGTIMAITCCAAVGKLGSGRISCSSLSDSID...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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