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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001321`

染色体: Chr07 坐标: 10144583-10148090 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001321`
名称	SmilChr07G001321
描述	nuclear pore complex protein NUP35
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10144583 - 10148090 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992485`
GeneID	`130992485`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992485`
原始查询	`SmilChr07G001321`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear pore complex protein NUP35
产物	nuclear pore complex protein NUP35
Arabidopsis	`AT3G16310` (AT3G16310) mitotic phosphoprotein N' end (MPPN) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820878] identity=67.5; qcov=1.01; evalue=8.25e-162; confidence=high
Rice	`Os01g0200500` - identity=52.4; qcov=0.691; evalue=3.15e-70; confidence=high
GO	GO:0003697 (single-stranded DNA binding); GO:0005543 (phospholipid binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0006607 (NLS-bearing protein import into nucleus); GO:0006999 (nuclear pore organization); GO:0017056 (structural constituent of nuclear pore); GO:0031965 (nuclear membrane); GO:0044613 (nuclear pore central transport channel); GO:0044615 (nuclear pore nuclear basket)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05172 (RRM_Nup35); PF14605 (Nup35_RRM_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992485

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773118.1`
2	Nuclear pore complex	核孔复合体	1.00000	`XP_057773118.1`
3	Nucleus membrane	核膜	1.00000	`XP_057773118.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057773118.1`
5	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057773118.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:10145183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,C82
`Chr7:10146046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:10146854`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr7:10147087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr7:10147104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773118.1

337 aa

168

337

RRM_Nup35

Nup35_RRM_2

PF05172 RRM_Nup35 188-273 aa PF14605 Nup35_RRM_2 192-244 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773118.1`	Pfam	`PF05172`	RRM_Nup35	Domain	188	273	1.8e-31	108.6	Nup53/35/40-type RNA recognition motif
`XP_057773118.1`	Pfam	`PF14605`	Nup35_RRM_2	Domain	192	244	5.2e-08	33.4	Nup53/35/40-type RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917135.1
TGCTCCTATAAAAAAAAGGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGGAGATTAAAATAAAATTAGGGTTTTTCATATCAGTGCTCTGCTTTCTGCTCACTACTGTTTGGGGAAATCTTCCTTAAAACCCTCCAAATTCAAAATTCCTGTAGCTCATCGTTGCCGTCACTATATTCAGGGAGGCACAAAGACAAAATGAGCACAAGTGTCCGCAGAACCCCCAAATCTGGGAGGCAATCCCTGTTTTTCCAAGATTTAGCAACGCCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992485
ATGAGCACAAGTGTCCGCAGAACCCCCAAATCTGGGAGGCAATCCCTGTTTTTCCAAGATTTAGCAACGCCTGTGTCATCTCGACGGTCTGGGGGAAAGTTTACAACCCCCGGTCAGGCAGCTGCTGTTTCTGCTCTATGGCGTGAAAATTTTTCCAACTCTGATCTTCCTCCTCCCCCCGCTTTTACCCTTGAAGACCGCTTTGATCAATCTCCAGAATCAGGGATACCTGACTATCCAGTGTCTCCAGAAGTAAAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773118.1
MSTSVRRTPKSGRQSLFFQDLATPVSSRRSGGKFTTPGQAAAVSALWRENFSNSDLPPPPAFTLEDRFDQSPESGIPDYPVSPEVKSDPRTPLQSFGRELSTPKSKSDASTSYAGASKQSQQQSQQSPMVSSSWWSPAKTGGSAEQEDKGKGSPVEGVVQPGALITLPPPREVARPEVKKSLLPVGNMNEEEWVTVYGFLPADTNLILREFEKCGVILKHVPGPREANWMHILYQNRSDAQRALSKNGMEVNGVLIIGVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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