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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001325`

染色体: Chr07 坐标: 10184553-10191286 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001325`
名称	SmilChr07G001325
描述	uncharacterized SmilChr07G001325
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10184553 - 10191286 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992489`
GeneID	`130992489`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992489`
原始查询	`SmilChr07G001325`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SIN-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835014]; symbol=AT5G49530; hit=AT5G49530; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	SIN-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835014]; symbol=AT5G49530; hit=AT5G49530; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G49530` (AT5G49530) SIN-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835014] identity=41.5; qcov=1.05; evalue=8.07e-155; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005666 (RNA polymerase III complex); GO:0006351 (DNA-templated transcription)
KEGG	smil03020 (RNA polymerase - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04801 (RPC5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992489

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773124.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773124.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773124.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773124.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773124.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:10186571`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A16
`Chr7:10186571`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A16
`Chr7:10187669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,C26,C48,C5,C82
`Chr7:10187761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr7:10189243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr7:10189548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B66
`Chr7:10190752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr7:10190785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B69
`Chr7:10190870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773124.1

681 aa

340

681

RPC5

PF04801 RPC5 103-478 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773124.1`	Pfam	`PF04801`	RPC5	Family	103	478	1.1e-92	312.3	RPC5 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917141.1
AAAATTTGCATTCGATTAATCCAGTAGGAACCGAGCGATCGGGCTGAGTCGAAACTGAGCCAGACCGGTGGGATGTGATTTTTGATCATCGCAACAGAAAGTAATCACCCGCCAAAGCCATCGCGACCAACCTATTAAGCCCTAAACCTTCACCACTTCTCCGCAGGCGCATTTCGTCGAACATTTCTAGGGCTCAAAATTCGTTGCTATCCTTCAGTCGCCCAAGCGAGCATGGACATGGATCTCGACGATTTCGACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992489
ATGGACATGGATCTCGACGATTTCGACGATGGCCCGAAACAGGGCCCGACCCGGGCTTCTCGCTTCGCGCCTAAGGGCTCAAAATTCCAGCCCAAACCCAAACCCAAGCCGAAAACCGAACCGCCATCGTCGTCGGCATCTTTGTCACTGCCCGCGCCCAAGAAGGAAGAAGTCGATGTCAAGCCCGAGATAAAGCCCGAACATGAGAACGGCGCAGTTGCAATGGATGTTGAGCTAAACCTCAGTGAGAAAGAAATGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773124.1
MDMDLDDFDDGPKQGPTRASRFAPKGSKFQPKPKPKPKTEPPSSSASLSLPAPKKEEVDVKPEIKPEHENGAVAMDVELNLSEKEMEVAGESVDTELADGDGDEDEVVREIDVYFAPSVDPETRLYLFQYPLRPLWRPYELDDRCEEVRVKPTSAEVEVDLAIDVDSKNYDADADPRLKMKKQTLAPSWKPPQTNGYTVGVLNGNKLHLNPIHAAVQLRPSMSHLDETESKKKTGVSKNVEDAVKSEVQQEAKPSGMSKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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