当前解析结果
SmilChr07G001330| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001330 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001330 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G001330 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 10255659 - 10256695 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992494 |
|---|---|
| GeneID | 130992494 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992494 |
| 原始查询 | SmilChr07G001330 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | Avr9/Cf-9 rapidly elicited protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841644]; symbol=AT1G52140; hit=AT1G52140; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | Avr9/Cf-9 rapidly elicited protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841644]; symbol=AT1G52140; hit=AT1G52140; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT1G52140 (AT1G52140)Avr9/Cf-9 rapidly elicited protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841644] identity=39.8; qcov=1.24; evalue=1.82e-40; confidence=medium |
| Rice | Os06g0554600- identity=30.4; qcov=1.41; evalue=2.79e-20; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF05553 (DUF761) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992494 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.80000 | XP_057773128.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057773128.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057773128.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057773128.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773128.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:10256017 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B60,C15,C7 |
Chr7:10256028 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | C11,C33,C46,C62,C69 |
Chr7:10256109 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,B15,B36,B50,C10 |
Chr7:10256238 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057773128.1PF05553
DUF761 151-172 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057773128.1 |
Pfam | PF05553 |
DUF761 | Family | 151 | 172 | 1.8e-05 | 24.9 | Cotton fibre expressed protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。