Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001340`

染色体: Chr07 坐标: 10372565-10374035 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001340`
名称	SmilChr07G001340
描述	histidine-containing phosphotransfer protein 4
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10372565 - 10374035 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992503`
GeneID	`130992503`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992503`
原始查询	`SmilChr07G001340`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histidine-containing phosphotransfer protein 4
产物	histidine-containing phosphotransfer protein 4
Arabidopsis	`AT3G16360` (AHP4) HPT phosphotransmitter 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820883] identity=75.9; qcov=1; evalue=9.81e-81; confidence=high
Rice	`Os01g0743800` (OsPHP1) - identity=60.1; qcov=0.986; evalue=4.79e-64; confidence=high
GO	GO:0000160 (phosphorelay signal transduction system); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009736 (cytokinin-activated signaling pathway); GO:0009927 (histidine phosphotransfer kinase activity); GO:0016310 (phosphorylation); GO:0043424 (protein histidine kinase binding)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01627 (Hpt)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992503

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057773139.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057773139.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773139.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773139.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773139.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773139.1

145 aa

145

Hpt

PF01627 Hpt 39-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773139.1`	Pfam	`PF01627`	Hpt	Domain	39	122	2e-13	51.1	Hpt domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917156.1
AGAGGGGACCAAGCAACCCCCTTTGTCCCAATATCTATATATATAATGCAACCTCGTTTCATTCCCATCCCACAACACACCAATCCCTCTCTCTCTCTAAATTCCAAATTTTACTGCATTATCTCCATCCACCCACCCAAGAACCATGCAGAGACAACTAGCTAACATGAAGCAGTCCCTTTTTGATCAGGGATATCTCGATGAACAATTCATTCAGCTTGAAGAGCTGCAAGATGATGCGAATCCTAATTTCGTTGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992503
ATGCAGAGACAACTAGCTAACATGAAGCAGTCCCTTTTTGATCAGGGATATCTCGATGAACAATTCATTCAGCTTGAAGAGCTGCAAGATGATGCGAATCCTAATTTCGTTGAAGAAGTTGTCACGTTGTACTACCGCGATTCGGCTCGACTTATCCAAAATATTGACCAAGCCTTGGAGAAGAGCCCTCTTGATTTTTCGAAGCTGGACAGCTTCATGCATCAGTTCAAGGGCAGCAGTACAAGCATTGGAGCCAAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773139.1
MQRQLANMKQSLFDQGYLDEQFIQLEELQDDANPNFVEEVVTLYYRDSARLIQNIDQALEKSPLDFSKLDSFMHQFKGSSTSIGAKKVKSECTQFRDYCRVGNADGCKRTFQQLKKEYATLKKKVEVYFQFARQIGPVEKACRSK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器