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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001343`

染色体: Chr07 坐标: 10384575-10395296 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001343`
名称	SmilChr07G001343
描述	MMS19 nucleotide excision repair protein homolog
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10384575 - 10395296 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992504`
GeneID	`130992504`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992504`
原始查询	`SmilChr07G001343`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MMS19 nucleotide excision repair protein homolog
产物	MMS19 nucleotide excision repair protein homolog
Arabidopsis	`AT5G48120` (MET18) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834864] identity=43.9; qcov=1.02; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os07g0177100` (MMS19) - identity=40.8; qcov=0.569; evalue=1.16e-138; confidence=medium
GO	GO:0016226 (iron-sulfur cluster assembly); GO:0097361 (cytosolic [4Fe-4S] assembly targeting complex); GO:0097428 (GO:0097428)
KEGG	-
Pfam	PF12460 (MMS19_C); PF14500 (MMS19_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992504

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773140.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057773140.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057773140.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057773140.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773140.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:10385585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr7:10386062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B90,B92,C21,C73
`Chr7:10386154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B67,C45
`Chr7:10386162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr7:10386743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr7:10386764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B73,C53
`Chr7:10386992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr7:10387588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B90,B92,B93
`Chr7:10387675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B73
`Chr7:10387742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,B82
`Chr7:10387810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B2,B46
`Chr7:10388109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B2,B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773140.1

1151 aa

576

1151

MMS19_N

MMS19_C

PF14500 MMS19_N 46-311 aa PF12460 MMS19_C 703-1100 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773140.1`	Pfam	`PF14500`	MMS19_N	Domain	46	311	7.6e-77	259.1	Dos2-interacting transcription regulator of RNA-Pol-II
`XP_057773140.1`	Pfam	`PF12460`	MMS19_C	Repeat	703	1100	8.6e-34	118.0	RNAPII transcription regulator C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091301.1
CCTTCCCTCCCGGCGACAACAAGCAAAACCCTTAAATCGTCAACTTGCTCCGCGCGCTCCCTCTCTCTACACAACACACACACACACACACACAATGGGTGATTCAGTTCAATGGATTAAGCACATCGAATTGTACGTCAGCTCCACTGCCACTCCATCCCAACAGTCTGCCAGTGTGGAGGCGGTTGCCACTTTGTTAAAGAAGGGCTTTTTTACTCTAGAAACACTTGTCAAGGAATTGGAGATGTATTTGACTACCA...

XR_009091302.1
GAGATGTATTTGACTACCACTGATAACATTATCCGCTCTAAAGGAATTCTCCTCCTTGCTGAAGTGTTGGATCAACTAGCATCAAAGCACTTAAGTAGCAGTTCAATACATAGCCTAGTAGGATTCTTCACAGAAAGACTGACTGGAAAGCTTTACGTGGTGCTATTGTCGGCTGTTTGGCTTTACTGAGGAGAAAAGTTGATGTTGGATGTGTCACCGATTCTGAAGCAAAGGCTGTTGCTGAGTCTTATCTCCAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992504
ATGGGTGATTCAGTTCAATGGATTAAGCACATCGAATTGTACGTCAGCTCCACTGCCACTCCATCCCAACAGTCTGCCAGTGTGGAGGCGGTTGCCACTTTGTTAAAGAAGGGCTTTTTTACTCTAGAAACACTTGTCAAGGAATTGGAGATGTATTTGACTACCACTGATAACATTATCCGCTCTAAAGGAATTCTCCTCCTTGCTGAAGTGTTGGATCAACTAGCATCAAAGCACTTAAGTAGCAGTTCAATACATAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773140.1
MGDSVQWIKHIELYVSSTATPSQQSASVEAVATLLKKGFFTLETLVKELEMYLTTTDNIIRSKGILLLAEVLDQLASKHLSSSSIHSLVGFFTERLADWKALRGAIVGCLALLRRKVDVGCVTDSEAKAVAESYLQNLQVQSLGQHERKLSFQLMECLLNHYPGAIEDLGDNLVYGICEAIDGEKDPQCLLLVFHIVECLARLYPDGSGPLANYAEDMFEILGSYFPIHFTHPKGEDDDTKRELSRALMLAFASTPLFEP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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