Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001344`

染色体: Chr07 坐标: 10395634-10397826 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001344`
名称	SmilChr07G001344
描述	uncharacterized SmilChr07G001344
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10395634 - 10397826 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992507`
GeneID	`130992507`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992507`
原始查询	`SmilChr07G001344`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826866]; symbol=AT4G12540; hit=AT4G12540; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826866]; symbol=AT4G12540; hit=AT4G12540; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G12540` (AT4G12540) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826866] identity=36; qcov=0.956; evalue=1.09e-63; confidence=medium
Rice	`Os05g0532500` - identity=29.9; qcov=1.03; evalue=7.02e-36; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992507

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773146.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057773146.1`
3	Centromere	着丝粒	0.20000	`XP_057773146.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057773146.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057773146.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:10395833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr7:10397518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B29
`Chr7:10397518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917163.1
AGAGTAAAATTTTGAATTTAAGAGAGAGAAATTATCTCCAGTGACCGTTGGAGCACTTCCCACACACAAACTCGCACAGCAAAGAAGAAGAAGAGGATATGCTGAAGAACGCCGACGAATCGAAATTGAAATCGAAGATGAGGCTGAAATCGACGAGGAAGCCGCTCCGAGATGTTTCTAACGCCAACACAGCCGTTAAATCAGGCAGTAATGACAACAAAATATCCAAAAATGGCGGTGGAAAAGCTGGAGACGATTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992507
ATGCTGAAGAACGCCGACGAATCGAAATTGAAATCGAAGATGAGGCTGAAATCGACGAGGAAGCCGCTCCGAGATGTTTCTAACGCCAACACAGCCGTTAAATCAGGCAGTAATGACAACAAAATATCCAAAAATGGCGGTGGAAAAGCTGGAGACGATTCGCTCGATCGCCTTCTCCTCGTACATTCGGATCTATCCTCCCTCATACGACAGATAGATGAATTAGTCGTCGAAGCACTCCAGTTGAAAGGAAATGGCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773146.1
MLKNADESKLKSKMRLKSTRKPLRDVSNANTAVKSGSNDNKISKNGGGKAGDDSLDRLLLVHSDLSSLIRQIDELVVEALQLKGNGTRKEIKEFADVLSDMQTSLKPWVPRFQKAVLGQSTVSDNNSEQPMEKKALNVLKESTSTAAASPEEMKWESLVSPSPLVSWRAGCNTESGRQLFLLTPMPQRKAFSSKYQASSLHEKFPSDEVAHPVSLSGAVRNLGNDVCEGAVNNLITECASPQKVSNTNCSSYMMTPCMKM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器