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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001345`

染色体: Chr07 坐标: 10404800-10408260 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001345`
名称	SmilChr07G001345
描述	clavaminate synthase-like protein At3g21360
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10404800 - 10408260 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992508`
GeneID	`130992508`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992508`
原始查询	`SmilChr07G001345`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	clavaminate synthase-like protein At3g21360
产物	clavaminate synthase-like protein At3g21360
Arabidopsis	`AT3G21360` (AT3G21360) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821690] identity=56.7; qcov=1.01; evalue=1.94e-137; confidence=high
Rice	`Os01g0190000` - identity=49.1; qcov=1.02; evalue=2.72e-99; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02668 (TauD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992508

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057773147.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057773147.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057773147.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773147.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773147.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:10404955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr7:10405118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:10405142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr7:10405148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B69
`Chr7:10405550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B77,B78,B82,D5
`Chr7:10407611`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B36,B67,C45
`Chr7:10407611`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B36,B67,C45
`Chr7:10407617`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A13,B134,B38,B39,B5,B53,C12,C17,C57,C60,C63
`Chr7:10407684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr7:10407722`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B42,B43
`Chr7:10407722`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr7:10407739`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A25,B10,B114,B130,B23,B34,C12,C18,C2,C39,C42,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773147.1

326 aa

163

326

TauD

PF02668 TauD 41-322 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773147.1`	Pfam	`PF02668`	TauD	Domain	41	322	3.4e-37	129.5	Taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917164.1
ATGAGCATCACCACTATGAAATAAGCGAACCAAAACTGATCAAGGAAAAGAAAAAGAAAAAAAATGGCTGAAAAATATTCTAGCTTCTTCGCTAGTGTGAAGACCCCGTTTCAGAGAGAATACGGCGGAGTAACCTTTCCGGCCGTATTATCTCCGGCAACATCGGCGGCTGCTTTGGCAGCAGCCGTGAAGGAGCAGAAAACGTGGGTGGAGTCTCTTCTGCACATGCACGGCGCCATTCTATTTCGTGGCTTCGAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992508
ATGGCTGAAAAATATTCTAGCTTCTTCGCTAGTGTGAAGACCCCGTTTCAGAGAGAATACGGCGGAGTAACCTTTCCGGCCGTATTATCTCCGGCAACATCGGCGGCTGCTTTGGCAGCAGCCGTGAAGGAGCAGAAAACGTGGGTGGAGTCTCTTCTGCACATGCACGGCGCCATTCTATTTCGTGGCTTCGAATCTTTAGCCACAGCTTCCGACTTCAACGACGTCGTTGAAGCGTTCGGCTACGAGGAGCTGCCGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773147.1
MAEKYSSFFASVKTPFQREYGGVTFPAVLSPATSAAALAAAVKEQKTWVESLLHMHGAILFRGFESLATASDFNDVVEAFGYEELPYVGGPAPRTHVVGRVYTANDAPPHQKLHFHHEMAHLPSPPRKLFFFCEEESASRGETPILLSHIVYERMKEKYPDFVEKLEKLGWMYTRFMGEEDDLSSPLGRGWKSMYRTTDKIVAQQRAAEVKTKLEWVENGVKMIAGPTPGIKCDETRSRKVWFNSIATAYTTWGGKRNDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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