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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001348`

染色体: Chr07 坐标: 10434246-10436227 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001348`
名称	SmilChr07G001348
描述	uncharacterized SmilChr07G001348
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10434246 - 10436227 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992511`
GeneID	`130992511`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992511`
原始查询	`SmilChr07G001348`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03318 (ETX_MTX2); PF07468 (Agglutinin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992511

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057773149.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057773149.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773149.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773149.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773149.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:10434714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,C2,C39,C42
`Chr7:10435488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B69,D10
`Chr7:10435794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr7:10435800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr7:10435805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr7:10435842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr7:10435854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B35,B85,C4
`Chr7:10435874`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B67,B8,B9
`Chr7:10435874`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B67,B8,B9
`Chr7:10435876`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B8,B9
`Chr7:10435876`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,B9
`Chr7:10435889`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A3,A9,B35,B85,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773149.1

454 aa

227

454

Agglutinin

ETX_MTX2

PF07468 Agglutinin 29-95 aa PF07468 Agglutinin 148-272 aa PF03318 ETX_MTX2 292-411 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773149.1`	Pfam	`PF07468`	Agglutinin	Domain	29	95	1e-19	71.9	Agglutinin domain
`XP_057773149.1`	Pfam	`PF07468`	Agglutinin	Domain	148	272	1e-19	71.9	Agglutinin domain
`XP_057773149.1`	Pfam	`PF03318`	ETX_MTX2	Family	292	411	3.6e-10	40.8	Clostridium epsilon toxin ETX/Bacillus mosquitocidal toxin MTX2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917166.1
GAGTTGTCATAAACTTATCGATCTATAAATAGCGTCGACCCATTTCAGGAAAGAAACACACAGAAGACGGTCCAGGGAAAGCTTTAAAGCAATAGTTATAGTATTTCTTCTTTTCTGTTTCGGTTGGAGAAAACATGGCGCTTCCATCGTTCATCGTGATGTCCGTGCCAATGTATTCTGGATACACTTATGTACGCCGCAACGACGACGGCTCCGCCGTGGTGGGGGAAGACAGCATGTTCAGCCCGCTGGTGAAGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992511
ATGGCGCTTCCATCGTTCATCGTGATGTCCGTGCCAATGTATTCTGGATACACTTATGTACGCCGCAACGACGACGGCTCCGCCGTGGTGGGGGAAGACAGCATGTTCAGCCCGCTGGTGAAGATCGAATTGGAGCGCGCCACAACCAATGATAAATACGTCCACATACGCTTCTGCTACAACAACAAATACTGGCAGAAGAGCGACGGCGACGACGGCATCGTGGCCCTATCGAGCAAGCCCGAGGAGGACACGACGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773149.1
MALPSFIVMSVPMYSGYTYVRRNDDGSAVVGEDSMFSPLVKIELERATTNDKYVHIRFCYNNKYWQKSDGDDGIVALSSKPEEDTTKPSCTLFEVALLMPTLGNFTHVPTGRRVMMNNATKALYVDKAGSEGALLGYMDWSTLVKLPTHVAFKGDNEKYLQAFYDDHNYLKFKSDDPNYYLCSNTVSLMNDGHVRIKNDHWGMFWRRSPNWIWADSTDLTANNNDTLFWPVKIDADTIALRSAGNNRFCQRLTTDGMESC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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