当前解析结果
SmilChr07G001356| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001356 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001356 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G001356 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 10520111 - 10523911 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992520 |
|---|---|
| GeneID | 130992520 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992520 |
| 原始查询 | SmilChr07G001356 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os01g0765500; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os01g0765500; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os01g0765500- identity=45.2; qcov=0.107; evalue=6.6e-08; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992520 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057773166.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.60000 | XP_057773166.1 |
| 3 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.40000 | XP_057773166.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057773166.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773166.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:10520272 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B29,B64,C59,C74 |
Chr7:10520285 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B109,B110,B120,B65,C64 |
Chr7:10520785 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B8 |
Chr7:10520943 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B95,D4 |
Chr7:10520995 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B95,D4 |
Chr7:10521127 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B34,B49 |
Chr7:10521156 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B95,D4 |
Chr7:10521178 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B134,B53 |
Chr7:10521304 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B27,B59,C47 |
Chr7:10522225 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B84 |
Chr7:10522307 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B84 |
Chr7:10522330 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 10 | B14,B54,B55,B80,C23,C35,C40,C44,C81,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。