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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr07G001367

染色体: Chr07 坐标: 10607751-10608560 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr07G001367
名称SmilChr07G001367
描述uncharacterized SmilChr07G001367
染色体 / SeqIDChr07 / NC_080393.1
坐标与链方向10607751 - 10608560 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130993809
GeneID130993809
locus_tag-
NCBI NameLOC130993809
原始查询SmilChr07G001367

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述confidence=no_hit
产物confidence=no_hit
Arabidopsis-
-
Rice-
-
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130993809

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Secreted 分泌到胞外 0.40000 XP_057774830.1
2 Endoplasmic reticulum 内质网 0.40000 XP_057774830.1
3 Nucleus 细胞核 0.20000 XP_057774830.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057774830.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057774830.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr7:10607754 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B99,C3
Chr7:10607758 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B35,C48
Chr7:10607803 CGG * 2bp_deletion CDS_variant 5 B119,B30,B4,C15,C42
Chr7:10607874 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B65,C49
Chr7:10607963 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B137,B19
Chr7:10607983 C CA 1bp_insertion frameshift_variant 7 A2,B60,B61,B72,B81,C13,D2
Chr7:10607988 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C86
Chr7:10608014 G A EMS_canonical_SNV stop_gained 1 C38
Chr7:10608014 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C38
Chr7:10608030 C T EMS_canonical_SNV stop_gained 1 C3
Chr7:10608030 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C3
Chr7:10608125 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057918847.1
ATGGTGCGCGAGAGCAAGGCGCTGGGCAGCGCTGGGCATGAGGCAGCGCTGACGGGTGCGGTTGGCGGGGCTCGCAGCGCTGGCATGTGGCGTGTGGCTGAGCGGTGCGGGGGCGTGGCTGGGCGGTCTTGGCGGCTGGCAGCGCTGGCAGCGCTGGTGTGGCTGGGCGGGCTTGGCGGGCTGGCAGCGCTGGCGTGGCTGGGCCGGCTGAGCGGGCTGGCAAGAATCTCTACAAGCGCCCAGCCAAAATTTGGACAGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC130993809
ATGGTGCGCGAGAGCAAGGCGCTGGGCAGCGCTGGGCATGAGGCAGCGCTGACGGGTGCGGTTGGCGGGGCTCGCAGCGCTGGCATGTGGCGTGTGGCTGAGCGGTGCGGGGGCGTGGCTGGGCGGTCTTGGCGGCTGGCAGCGCTGGCAGCGCTGGTGTGGCTGGGCGGGCTTGGCGGGCTGGCAGCGCTGGCGTGGCTGGGCCGGCTGAGCGGGCTGGCAAGAATCTCTACAAGCGCCCAGCCAAAATTTGGACAGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057774830.1
MVRESKALGSAGHEAALTGAVGGARSAGMWRVAERCGGVAGRSWRLAALAALVWLGGLGGLAALAWLGRLSGLARISTSAQPKFGQRWRVAWWQRCQDYYTVRGGSAGGVAALPGAWLGLAGGLGGSGCAALTVAWLGGVAGSSGWQRWRGGSAARGHGWGWRVGWAVSGVCGVDGYVAGAGWLAVSGWQRWRVGSAARWHGWGWRGGLGGSGCAALTVAWLGGVAGSSGWQRWRVAALAGGMAWAVLAAGSSGWQRCQG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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