当前解析结果
SmilChr07G001369| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001369 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001369 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G001369 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 10626975 - 10629682 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992528 |
|---|---|
| GeneID | 130992528 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992528 |
| 原始查询 | SmilChr07G001369 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os01g0765500; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os01g0765500; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os01g0765500- identity=45.2; qcov=0.107; evalue=6.94e-08; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992528 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057773175.1 |
| 2 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.40000 | XP_057773175.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.40000 | XP_057773175.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057773175.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773175.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:10627497 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,B66 |
Chr7:10627811 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B95 |
Chr7:10627863 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B95 |
Chr7:10627970 |
A |
AGG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 26 | A23,B120,B132,B135,B15,B19,B25,B29,B32,B45,B47,B50,B54,B60,B62,B86,B99,C24,C34,C38,C43,C57,C59,C74,C85,D9 |
Chr7:10627974 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 24 | A23,B120,B132,B135,B15,B19,B25,B29,B32,B45,B47,B50,B54,B60,B62,B86,B99,C34,C38,C43,C57,C59,C74,D9 |
Chr7:10628021 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D4 |
Chr7:10628043 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B134,B53,C14,C73 |
Chr7:10628462 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | C2,C31,C61,D11 |
Chr7:10628513 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B8 |
Chr7:10628702 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B61,C73,C82,D7 |
Chr7:10628732 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B84 |
Chr7:10628974 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B126,C31 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。