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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001376`

染色体: Chr07 坐标: 10678577-10690592 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001376`
名称	SmilChr07G001376
描述	endo-1,4-beta-xylanase 1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10678577 - 10690592 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992545`
GeneID	`130992545`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992545`
原始查询	`SmilChr07G001376`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endo-1,4-beta-xylanase 1-like
产物	endo-1%2C4-beta-xylanase 1-like
Arabidopsis	`AT1G58370` (RXF12) glycosyl hydrolase family 10 protein / carbohydrate-binding domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842206] identity=64.3; qcov=0.999; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0456700` - identity=56.2; qcov=0.999; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00331 (Glyco_hydro_10); PF02018 (CBM_4_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992545

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057773200.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057773200.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773200.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773200.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773200.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:10678841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B53,B64,C72
`Chr7:10678917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,B84
`Chr7:10678928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B40,B76,B9,C38
`Chr7:10678933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr7:10679013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,B55,C41,C76
`Chr7:10679030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr7:10679100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B95,D4
`Chr7:10679100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,D4
`Chr7:10679105`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	87	A11,A14,A15,A19,A21,A24,A7,B101,B102,B107,B108,B109,B11,B112,B115,B117,B118,B120,B122,B126,B132,B138,B139,B14,B140,B17,B19,B20,B22,B25,B28,B3,B32,B33,B35,B36,B37,B40,B41,B45,B46,B52,B53,B58,B66,B67,B69,B71,B72,B73,B75,B76,B79,B8,B89,B9,B93,B94,B99,C1,C10,C11,C14,C16,C20,C3,C31,C33,C34,C36,C38,C39,C4,C41,C42,C51,C52,C55,C56,C58,C65,C69,C70,C79,C82,D2,D7
`Chr7:10679110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B53,B64,C6
`Chr7:10679132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,B75,B94
`Chr7:10679155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773200.1

1097 aa

548

1097

CBM_4_9

Glyco_hydro_10

PF02018 CBM_4_9 32-171 aa PF02018 CBM_4_9 208-347 aa PF02018 CBM_4_9 381-518 aa PF02018 CBM_4_9 599-695 aa PF00331 Glyco_hydro_10 753-1009 aa

XP_057773201.1

906 aa

453

906

CBM_4_9

Glyco_hydro_10

PF02018 CBM_4_9 17-156 aa PF02018 CBM_4_9 190-327 aa PF02018 CBM_4_9 408-504 aa PF00331 Glyco_hydro_10 562-818 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773200.1`	Pfam	`PF02018`	CBM_4_9	Domain	32	171	1.1e-79	266.1	Carbohydrate binding domain
`XP_057773200.1`	Pfam	`PF02018`	CBM_4_9	Domain	208	347	1.1e-79	266.1	Carbohydrate binding domain
`XP_057773200.1`	Pfam	`PF02018`	CBM_4_9	Domain	381	518	1.1e-79	266.1	Carbohydrate binding domain
`XP_057773200.1`	Pfam	`PF02018`	CBM_4_9	Domain	599	695	1.1e-79	266.1	Carbohydrate binding domain
`XP_057773200.1`	Pfam	`PF00331`	Glyco_hydro_10	Domain	753	1009	4.4e-45	155.0	Glycosyl hydrolase family 10
`XP_057773201.1`	Pfam	`PF02018`	CBM_4_9	Domain	17	156	3.9e-60	202.9	Carbohydrate binding domain
`XP_057773201.1`	Pfam	`PF02018`	CBM_4_9	Domain	190	327	3.9e-60	202.9	Carbohydrate binding domain
`XP_057773201.1`	Pfam	`PF02018`	CBM_4_9	Domain	408	504	3.9e-60	202.9	Carbohydrate binding domain
`XP_057773201.1`	Pfam	`PF00331`	Glyco_hydro_10	Domain	562	818	3.1e-45	155.5	Glycosyl hydrolase family 10

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917217.1
TCACTGCAAAATCTTCCATTCTAATTCAAGCATCCCAATCCCACAACGCGCCGCAACACCTACCTGCAATCCAAAGGAATCCAATGCCTAAATACTGCAAAAATCAATCTTCTAATGCACCAAAATCAGCAATCTTGGCGCTGAGATCAGTCAATTTAAAGTCCAAAGTGAAGATGATTATGCGATTCCAATTTGTGTATGTATGTCAATTGGATCATGTTGAAGACATACAACTGCTAAAACGCCCGAAAATTGATTGG...

XM_057917218.1
AACACAAAACCCTTCCCCACTTCTCCTTCACAGAGTCATAGCTGCGCCTCTTTCTTCTCCAATCTCTCTCGGCTCTCTTCCCAGAAGTTCCGCCGCCGCGGAAGCTCGCCGGAGGAGCAGCGGCGATAAGCCGCCACCACCAGCTCCTTCTGATCTCCGTTCTCCCTTCTCTCTCCGACAGCGACGGAGACCGCCGCCACCAGTCAACCATCTTACTCCGCCTCTCTCTCAAAAATTCCAGCGAAACCATCGCCGTCTCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992545
ATGGAGAAGCCATCCACGAGCAACGCCAATGGTAACGCTCCTTTGGAGAAGTTGAATGAGCAATTGAATGATACAATCAGCAGACCTGCAACTAATGTCATCCTTAGCCATGACTTTTCTGGAGGACTTCATTCGTGGCATCCTAATGGCTGTGATGGCTTTGTGGTTTCCTCAGATTCTGGTTATCCTCAAGGGGTACCAGCTAGCGTAAATGGTCATTTCGCCATAGTTACGAACCGGAATGAATGCTGGCAAGGCCT...

LOC130992545
ATGAAGCCGAATGAGGAATTGAATGATACAATCAGCAGATCTGCAACTAATGTCATCCTTAACCATGATTTTTCTGGAGGACTTCATTCGTGGAGTCCTAATGGCTGTGATGGCTTTGTGGTTTCCTCAGACTCTGGTTACCCTCAAGTGATACCAGCTAGCCTAAATGGTCGTTTCGCCAAAGTTACAAACCGGAATGAATGCTGGCAAGGCCTCGAACAAGATATAACCAACAGGGTTTCGGCAGGTTCCACTTATAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773200.1
MEKPSTSNANGNAPLEKLNEQLNDTISRPATNVILSHDFSGGLHSWHPNGCDGFVVSSDSGYPQGVPASVNGHFAIVTNRNECWQGLEQDITDRVSAGSTYTVCAWVGISGYGQAVADVQATLKLEYQHSSVSYLFIGRTSASMGRFEKLEGTFCLSTSPQRVTFYMEGPPPGIDILIKSVVVSCPESSQYDKPNEELNDTISRSATNVILNHDFSGGLHSWSPNGCDGFVVSSDSGYPQVIPASLNGRFAKVTNRNECW...

XP_057773201.1
MKPNEELNDTISRSATNVILNHDFSGGLHSWSPNGCDGFVVSSDSGYPQVIPASLNGRFAKVTNRNECWQGLEQDITNRVSAGSTYTVCAWVGILGSGQAVADVQATLKLEYQDSSVSYLPIGRTSASIGCFEKIEGTFCVSTMPHRVIFYLEGPPPGVDILVKSVVVSCPVSSQYDTQRKSFLFDDDGDIVQNPRFDGGLNNWSGRGCNIVLNESTAGGKILPQTGKYFASTANRTQNWNGIQQEITSRVQQKLAYEVF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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