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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001391`

染色体: Chr07 坐标: 10782308-10786261 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001391`
名称	SmilChr07G001391
描述	PHD finger protein EHD3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10782308 - 10786261 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992578`
GeneID	`130992578`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992578`
原始查询	`SmilChr07G001391`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PHD finger protein EHD3
产物	PHD finger protein EHD3
Arabidopsis	`AT1G77250` (AT1G77250) RING/FYVE/PHD-type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844061] identity=42.4; qcov=0.735; evalue=2.48e-97; confidence=medium
Rice	`Os08g0105000` (EHD3) - identity=31.9; qcov=0.738; evalue=5.21e-59; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00628 (PHD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992578

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773249.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773249.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773249.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773249.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773249.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:10783494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:10783562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,C76
`Chr7:10784942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr7:10785099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B60,C15,C64,C66
`Chr7:10785184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:10785296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773249.1

575 aa

288

575

PHD

PF00628 PHD 312-356 aa PF00628 PHD 465-509 aa

XP_057773250.1

543 aa

272

543

PHD

PF00628 PHD 280-324 aa PF00628 PHD 433-477 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773249.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	312	356	5.9e-20	71.7	PHD-finger
`XP_057773249.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	465	509	5.9e-20	71.7	PHD-finger
`XP_057773250.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	280	324	4.5e-20	72.1	PHD-finger
`XP_057773250.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	433	477	4.5e-20	72.1	PHD-finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917267.1
AACGAAACGCCGGAAGCAAAAATAACTCATTTTTCAAAATTTTGAAAACCCCCCTCCCATCTCTCTGTCTCAGATAATACGCACAAATTGGGCGCAACTTTATCTCTCTAGGGTTCCAAATCCCACCCGCTAACGACATTTCTCTCCCTATCTCTTTCCACTCTCCAACTCCAGGGGGATTCGAAATTCTTGATTGCTCCGGGTCCGAATTGTTATGACAGTTTTCTTAGGTGGTTAGCGTTGCTTAATTGAAGATTAGG...

XM_057917266.1
CGAAACGCCGGAAGCAAAAATAACTCATTTTTCAAAATTTTGAAAACCCCCCTCCCATCTCTCTGTCTCAGATAATACGCACAAATTGGGCGCAACTTTATCTCTCTAGGGTTCCAAATCCCACCCGCTAACGACATTTCTCTCCCTATCTCTTTCCACTCTCCAACTCCAGGGGGATTCGAAATTCTTGATTGCTCCGGGTCCGAATTGTTATGACAGTTTTCTTAGGTGGTTAGCGTTGCTTAATTGAAGATTAGGCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992578
ATGGTGGATGCTCACAATGAAAGTAATGTGAACGGTGGTCGAAGTAATTTTGAGAGTTTAGTAGGGTCCTCTGATGTTGAGGAGGTGAAGGCTAATGGCGTTGCAGTCGATGCTGAAGCTGGTCCTTCGGGATTGGGAGGAGATAGCTTGCTTACCTACAAGAGGCGAAAGAGTATCAAGATTATGGAGTGTGGGAAGGTTTTCGGTGATTCAGCGAGTCAGCTGAGTGAGAAGAAAGGTGCAGATTGTTCCAATGGTTG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773249.1
MVDAHNESNVNGGRSNFESLVGSSDVEEVKANGVAVDAEAGPSGLGGDSLLTYKRRKSIKIMECGKVFGDSASQLSEKKGADCSNGCSLKQKRNIILDQICQSLDIGGLKKCMESALVFPTASCSETTIKDSVRSSEHWRKNTSQNGTLLDGLQNATKSNVGLTSSGSVNGLYTTTFTERCIGTFVDVFMSEQFARLCSLLLENFEGIKPDKLFDLNHISTRMKEKAYEQSPLLFQSDVQEFWAKLQKVGSDITALAKCL...

XP_057773250.1
MVDAHNESNVNGGRSNFESLVGSSDVEEVKANGVAVDAEAGPSGLGGDSLLTYKRRKSIKIMECGKVFGDSASQLSEKKGADCSNGCSLKQKRNIILDQICQSLDIGGLKKCMESALVFPTASCSETTIKDSVRSSEHWRKNTSQNGTLLDGLQNATKSNVGLTSSGLLLENFEGIKPDKLFDLNHISTRMKEKAYEQSPLLFQSDVQEFWAKLQKVGSDITALAKCLSDKTMASLHEQCPQVSNPANSMSEGTKHEVEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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