当前解析结果
SmilChr07G001392| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001392 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001392 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G001392 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 10787857 - 10791542 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992618 |
|---|---|
| GeneID | 130992618 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992618 |
| 原始查询 | SmilChr07G001392 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os04g0221000; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os04g0221000; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | AT4G01170 (AT4G01170)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826561] identity=32.1; qcov=0.309; evalue=3.01e-14; confidence=low |
| Rice | Os04g0221000- identity=38.8; qcov=0.243; evalue=2.28e-14; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992618 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057773309.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057773309.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.40000 | XP_057773309.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773309.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057773309.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:10789118 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B51 |
Chr7:10789167 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:10789476 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B73 |
Chr7:10789505 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,B132,B85,C61 |
Chr7:10789518 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B97,C5,C71,C76 |
Chr7:10789529 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B51 |
Chr7:10789621 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B51 |
Chr7:10789782 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,C82 |
Chr7:10790235 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C51 |
Chr7:10790983 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B133 |
Chr7:10790995 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C31,C61 |
Chr7:10791344 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B46 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
6 records
下载 cDNA FASTA6 records
下载 CDS FASTA6 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。