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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001394`

染色体: Chr07 坐标: 10815265-10818962 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001394`
名称	SmilChr07G001394
描述	PLASTID TRANSCRIPTIONALLY ACTIVE protein 6, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10815265 - 10818962 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992643`
GeneID	`130992643`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992643`
原始查询	`SmilChr07G001394`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PLASTID TRANSCRIPTIONALLY ACTIVE protein 6, chloroplastic
产物	PLASTID TRANSCRIPTIONALLY ACTIVE protein 6%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G21600` (PTAC6) plastid transcriptionally active 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838761] identity=78.4; qcov=0.83; evalue=1.98e-151; confidence=high
Rice	`Os12g0110400` - identity=61.9; qcov=0.796; evalue=4.76e-106; confidence=high
GO	GO:0000427 (plastid-encoded plastid RNA polymerase complex)
KEGG	-
Pfam	PF28675 (PTAC6_N); PF28676 (PTAC6_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992643

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057773349.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057773349.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057773349.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773349.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773349.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:10816777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773349.1

323 aa

162

323

PTAC6_N

PTAC6_C

PF28675 PTAC6_N 101-252 aa PF28676 PTAC6_C 254-314 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773349.1`	Pfam	`PF28675`	PTAC6_N	Domain	101	252	4.5e-78	261.2	PTAC6 N-terminal domain
`XP_057773349.1`	Pfam	`PF28676`	PTAC6_C	Domain	254	314	1.2e-33	115.4	PTAC6 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917366.1
TTTCGTGGATGATTAACATACTTAAACCAAATAAAATAAAATATTTATTCAGTTCCCCGGTGTACCATATTTATTCGAATTGAGGCGAGTTCAATTTTTGTTGAGTTCCCCGGTGTACCATATCATAACCCATATATTAAATTCATTTAAACCAAATAAAATAAAATATCTAATCCACTTCTTCACTTTCCCTCTTTTCCCACTCCCAACCTCCGCAAACCTCAGCTTCCACCGCGACGCCGCCATGAACGCGGCCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992643
ATGAACGCGGCCTCTCTCTTCCTCACACCCCTCTTTCCTGTGAACTCCCGCACCGCCCGGCCGCTTTCTATCCCAAAGCTCAACATTATCCGCTCACTGCCAATGGCCCGGTCCCTATCTTCCAGACCGGACTTCCGCGTCCGCGCTGACGACGGAGACGCTGACGGCGGAGGTCCGGACGAATACGACATGGACGACGACGAGGTCGAGGAGGTCGACAATAAGAAGGACTTCGACGTCGATTATGACACGGCCGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773349.1
MNAASLFLTPLFPVNSRTARPLSIPKLNIIRSLPMARSLSSRPDFRVRADDGDADGGGPDEYDMDDDEVEEVDNKKDFDVDYDTAAALAVASAGGGAEEEIEMVHSKSFVSIQGWDSEKIVDYRINEDEFHKICLLDCDFFIRKPPDPDNDVYDFREMYVTPPDTDVYAIPKVLAPMPEKYIRCAQSDYGCYNVTEPPIDAPRDPMYKSEREVLKVFLTKHYRNRRYGDPEFMLDFEEIYVIDSKTRSISRATVMVTVPG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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