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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001407`

染色体: Chr07 坐标: 10944156-10949833 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001407`
名称	SmilChr07G001407
描述	proteasome subunit beta type-3-B-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	10944156 - 10949833 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992691`
GeneID	`130992691`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992691`
原始查询	`SmilChr07G001407`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proteasome subunit beta type-3-B-like
产物	proteasome subunit beta type-3-B-like
Arabidopsis	`AT1G77440` (PBC2) 20S proteasome beta subunit C2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844080] identity=82.3; qcov=0.756; evalue=1.3e-30; confidence=medium
Rice	`Os06g0643100` (OsPBC1) - identity=75.8; qcov=0.756; evalue=8.7e-29; confidence=medium
GO	GO:0005839 (proteasome core complex); GO:0051603 (GO:0051603)
KEGG	-
Pfam	PF00227 (Proteasome)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992691

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057773426.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057773426.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773426.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773426.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773426.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:10944787`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B121
`Chr7:10944787`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B121
`Chr7:10946112`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A14,B65,B89,C19,C27,C60,C68
`Chr7:10949264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773426.1

82 aa

Proteasome

PF00227 Proteasome 4-64 aa

XP_057773427.1

82 aa

Proteasome

PF00227 Proteasome 4-64 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773426.1`	Pfam	`PF00227`	Proteasome	Domain	4	64	4.6e-09	36.9	Proteasome subunit
`XP_057773427.1`	Pfam	`PF00227`	Proteasome	Domain	4	64	4.6e-09	36.9	Proteasome subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917444.1
TAACATAATTTCAATTTCAGTTGCTAATACTGTGTGTTTGTGGCTCGATGTTTTGTGTTGTTTGATGTAACTTGTTAAAAATTGCGGAGCTTGAGGCACACCAAAATCTCATTTAGGTATCAACGGCTTGTATTTCGTCATAAGTTATATCATCTACGAGAAGAGAGAGACATGAAGCCTAAAACTTTTGCTAGCCTTGTATCTGCTCTTCTTTATGAAAAAAGATTTTACTCCTCGTCACTGGCAACCTGTTATTGCTG...

XM_057917443.1
ATTTCAATTTCAGTTGCTAATACTGTGTGTTTGTGGCTCGATGTTTTGTGTTGTTTGATGTAACTTGTTAAAAATTGCGGAGCTTGAGGCACACCAAAATCTCATTTAGGTAAACTCTACTAGGTTTGATGATCATTATCACATAGTATTTGTCCTCTTTGAGCTGAAGCCTTGCATTAGAACTGGATGTGCTCGTTCTCAAATGTACATATTTTCACTGTGTTTCTATTTGGAAGCTGAGTTCTAAGACTGGGGCTGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992691
ATGAAAAAAGATTTTACTCCTCGTCACTGGCAACCTGTTATTGCTGGATTGGGAGATGATGGAAAACCCTTCATTTGCACCATGGATTCTATTGGAGCCAAAGAACTGGCAAAAGATTTTGTAGTTTCTGGATCAGCCTTCGAATCACTTTATGGTGCCTGTGAGTCAATGTTCAAGCCTGACATGAATTTGTCATTTGACGCCTTCCACTCTCTAAAGAAATACCAAGTAGAAAAATTTGTGTCTTAA

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773426.1
MKKDFTPRHWQPVIAGLGDDGKPFICTMDSIGAKELAKDFVVSGSAFESLYGACESMFKPDMNLSFDAFHSLKKYQVEKFVS

XP_057773427.1
MKKDFTPRHWQPVIAGLGDDGKPFICTMDSIGAKELAKDFVVSGSAFESLYGACESMFKPDMNLSFDAFHSLKKYQVEKFVS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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