当前解析结果
SmilChr07G001409| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001409 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001409 |
| 描述 | guanine nucleotide-binding protein-like NSN1 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 10959849 - 10962971 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130992681 |
|---|---|
| GeneID | 130992681 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992681 |
| 原始查询 | SmilChr07G001409 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | guanine nucleotide-binding protein-like NSN1 |
| 产物 | guanine nucleotide-binding protein-like NSN1 |
| Arabidopsis | AT3G07050 (NSN1)GTP-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819890] identity=54.8; qcov=0.876; evalue=1.27e-33; confidence=medium |
| Rice | Os01g0375000 (Os_F0781)- identity=46.1; qcov=0.944; evalue=7.93e-28; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992681 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057773414.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057773414.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773414.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057773414.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057773414.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:10960058 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B7,B80,C17,C40 |
Chr7:10960086 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B122 |
Chr7:10960125 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C15 |
Chr7:10960125 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C15 |
Chr7:10960197 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C51,C53 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。