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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001413`

染色体: Chr07 坐标: 11003977-11006448 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001413`
名称	SmilChr07G001413
描述	uncharacterized SmilChr07G001413
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	11003977 - 11006448 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992659`
GeneID	`130992659`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992659`
原始查询	`SmilChr07G001413`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Integral membrane HRF1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839973]; symbol=AT1G30890; hit=AT1G30890; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Integral membrane HRF1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839973]; symbol=AT1G30890; hit=AT1G30890; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G30890` (AT1G30890) Integral membrane HRF1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839973] identity=82.2; qcov=1.01; evalue=2.89e-160; confidence=high
Rice	`Os04g0165400` - identity=64.4; qcov=1.05; evalue=1.97e-128; confidence=high
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0005793 (endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment); GO:0006888 (endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport); GO:0030134 (COPII-coated ER to Golgi transport vesicle)
KEGG	-
Pfam	PF03878 (YIF1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992659

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057773378.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057773378.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057773378.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773378.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773378.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:11005110`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B117,C19,C34,C7
`Chr7:11005110`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B117,C19,C34,C7
`Chr7:11005118`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B117,C19,C34,C7
`Chr7:11005118`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B117,C19,C34,C7
`Chr7:11005130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773378.1

265 aa

132

265

YIF1

PF03878 YIF1 40-256 aa

XP_057773380.1

265 aa

132

265

YIF1

PF03878 YIF1 40-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773378.1`	Pfam	`PF03878`	YIF1	Family	40	256	2.5e-53	181.8	YIF1
`XP_057773380.1`	Pfam	`PF03878`	YIF1	Family	40	256	2.5e-53	181.8	YIF1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917395.1
AATGGGCCCATTATGTAAGCCCAAATATCAGACGCAGTCCTTCCTAAGCCCAGCCCACCACTGTTCGGCAAAGCTCATCAAAACTCTGTCGTTTGCATTTTTCCTCTCTACCGGCGAGAAATTATTCCATTTCCTTCACCGAAATTTGATTGATTCAGGGTAAAGATGTATGATAATGTTGGACCGCAGCTTGGTGTCCCTCGGCCACCTAATGCTCAACCAAACCCTTTTGAAAATTCGTTTTATGGTGCAAGTTCGGG...

XM_057917397.1
CATTTCCTTCACCGGTAAGCTTCTCTCTCTCTTTGCGCTTTTGATTTCTTGAAGAAACCAATCTCTTGAAAAATCCGGCATATATTGGGGCTTAAACTGGATCCGAATTGGTCGGGGATCGGATGCAGGATTCCGCTGTGATAAATTTGATTGATTCAGGGTAAAGATGTATGATAATGTTGGACCGCAGCTTGGTGTCCCTCGGCCACCTAATGCTCAACCAAACCCTTTTGAAAATTCGTTTTATGGTGCAAGTTCGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992659
ATGTATGATAATGTTGGACCGCAGCTTGGTGTCCCTCGGCCACCTAATGCTCAACCAAACCCTTTTGAAAATTCGTTTTATGGTGCAAGTTCGGGATTCATTAGAGGTGGACTGGGTGCTTACGGAGAGAAGATTCTAGGATCTAGCTCTGAATATGTGCAAAGCAATATCAGTAGGTACTTTTCCGATCCACAATACTATTTTCAAGTCAATGATCAATATGTGAAGAACAAATTGAAGGTCGTTCTTTTCCCATTTCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773378.1
MYDNVGPQLGVPRPPNAQPNPFENSFYGASSGFIRGGLGAYGEKILGSSSEYVQSNISRYFSDPQYYFQVNDQYVKNKLKVVLFPFLHRGHWTRISEPVGGRLSYKPPIYDINAPDLYIPFMAFGTYLVLAGLSLGLHGKFSPEALNWLFAKGLVGWVFQVGLLKMTLLSLGSGEAPLLDMVAYAGYTFTGLSLAVFGRIFWSYAYYFLLPWTCLGMGIFLVKTMKRVLFAGYDSTRHHYLLLFIALAQFPLLVWLGNIS...

XP_057773380.1
MYDNVGPQLGVPRPPNAQPNPFENSFYGASSGFIRGGLGAYGEKILGSSSEYVQSNISRYFSDPQYYFQVNDQYVKNKLKVVLFPFLHRGHWTRISEPVGGRLSYKPPIYDINAPDLYIPFMAFGTYLVLAGLSLGLHGKFSPEALNWLFAKGLVGWVFQVGLLKMTLLSLGSGEAPLLDMVAYAGYTFTGLSLAVFGRIFWSYAYYFLLPWTCLGMGIFLVKTMKRVLFAGYDSTRHHYLLLFIALAQFPLLVWLGNIS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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