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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001416`

染色体: Chr07 坐标: 11019756-11020617 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001416`
名称	SmilChr07G001416
描述	protein DMP3-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	11019756 - 11020617 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992675`
GeneID	`130992675`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992675`
原始查询	`SmilChr07G001416`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DMP3-like
产物	protein DMP3-like
Arabidopsis	`AT4G24310` (AT4G24310) transmembrane protein, putative (DUF679) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828534] identity=54.3; qcov=0.99; evalue=5.07e-73; confidence=high
Rice	`Os08g0106501` - identity=60.9; qcov=0.852; evalue=3.61e-64; confidence=high
GO	GO:0010256 (endomembrane system organization)
KEGG	-
Pfam	PF05078 (DUF679)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992675

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057773408.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057773408.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057773408.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057773408.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773408.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:11019850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr7:11020020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr7:11020089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,D1
`Chr7:11020110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B39,B55,B59,C23
`Chr7:11020189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B51,C46
`Chr7:11020444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B51,C46
`Chr7:11020447`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B130,D11
`Chr7:11020447`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B130,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773408.1

210 aa

105

210

DUF679

PF05078 DUF679 41-202 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773408.1`	Pfam	`PF05078`	DUF679	Family	41	202	3.8e-65	219.5	Protein of unknown function (DUF679)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917425.1
TATATATATATATATATCACCCAACCCAACATCAAGTTAATTCTCAAACAAACTTGAACATTTGACAAAAAATGTCTCTTAGACAAAGATCATCGGCATCAATCCCCAATGAACCTCCCACCAACTCGTCTCAAAACGACGTCGTTTCGGTTACCCCGCCGCCCCAGAGCGCGCTCGCCCAAGCCCTACGAGGCTCGGCGAACCTCGCCAACCTCCTCCCGACCGGCACCCTTTTGGCCTTCCAGCTCCTAACCCCAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992675
ATGTCTCTTAGACAAAGATCATCGGCATCAATCCCCAATGAACCTCCCACCAACTCGTCTCAAAACGACGTCGTTTCGGTTACCCCGCCGCCCCAGAGCGCGCTCGCCCAAGCCCTACGAGGCTCGGCGAACCTCGCCAACCTCCTCCCGACCGGCACCCTTTTGGCCTTCCAGCTCCTAACCCCAATCTTCACCAACGGCGGCGCGTGCGACGCCGCCACGCGGCCCATGACCTTCGCCCTCCTCCTCGTCCTGGCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773408.1
MSLRQRSSASIPNEPPTNSSQNDVVSVTPPPQSALAQALRGSANLANLLPTGTLLAFQLLTPIFTNGGACDAATRPMTFALLLVLALSCFLASFTDSLRCANGEVHYGFATREGLWLFDSPDAAALPDLRKFRLNAMDVVHAFVSVMVFVAVALRDKNAVGCFYPRPAREVQEVLDIAPIGIGLISSLLFVVFPSRRNGIGYPVTRDPMN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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