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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001417`

染色体: Chr07 坐标: 11021781-11024859 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001417`
名称	SmilChr07G001417
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD3-1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	11021781 - 11024859 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992555`
GeneID	`130992555`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992555`
原始查询	`SmilChr07G001417`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD3-1
产物	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD3-1
Arabidopsis	`AT2G41890` (AT2G41890) curculin-like (mannose-binding) lectin family protein / PAN domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818789] identity=35.5; qcov=0.926; evalue=1.53e-132; confidence=medium
Rice	`Os01g0870400` (P0039A07.14) - identity=27.6; qcov=1.05; evalue=6.84e-77; confidence=low
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0048544 (recognition of pollen)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00954 (S_locus_glycop); PF01453 (B_lectin); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992555

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057773214.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773214.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773214.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773214.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773214.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:11022879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr7:11022880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:11022930`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr7:11022930`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr7:11023007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B30,B82,B84,C84
`Chr7:11023339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr7:11023348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr7:11023350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C38
`Chr7:11023502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr7:11023630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr7:11023636`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr7:11023657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773214.1

801 aa

400

801

B_lectin

S_locus_glycop

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF01453 B_lectin 125-198 aa PF00954 S_locus_glycop 274-334 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 553-691 aa PF00069 Pkinase 563-700 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773214.1`	Pfam	`PF01453`	B_lectin	Repeat	125	198	2.2e-18	67.3	D-mannose binding lectin
`XP_057773214.1`	Pfam	`PF00954`	S_locus_glycop	Domain	274	334	1.9e-11	45.2	S-locus glycoprotein domain
`XP_057773214.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	553	691	2.5e-20	73.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057773214.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	563	700	2.3e-18	67.3	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917231.1
TCAAATCGTTTGAGGGGGACGAGTCATAGACATAGTAATGGTGGATTACTCTGTCATGAAAAGGAAAAGAAATTAAAACAAAAATTGCGTATGTCTACAGCTTGATTAGGTAGGCTTTGAATTTCACATGGATAGATTAATATTTAATTAGTAGAGCTGACTGCTCGTGTCAAAGCATGCTGATGCAGTGTTCAATCCAAGAAATTAAAATAAGGATCCCATAAAAAGTAGAGATTGTTTTAGTGGGAGCAAACTCAGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992555
ATGGGTGTTTCTTGGCTGCTCAGACAGCAGCTTACAGGGCTAACTGCCAAGAAGTCTGGTGGTAAGAATCTGACAAAATGTTGTTTGACTAGGTGCAGTTGTGTGCCTATTATGCTACTGTTTTTGTGCTCTGTTTTTTGTGGAGTGTTTTGTGATGATTCTACCATGGCCTCTGTGCCTATTGGTTTTGAGGTTAATGCTTTTGATAGGGATAAGGTTTGGGTGTCTGAAAATGGGGTTTTTGCATTTGGTTTCTTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773214.1
MGVSWLLRQQLTGLTAKKSGGKNLTKCCLTRCSCVPIMLLFLCSVFCGVFCDDSTMASVPIGFEVNAFDRDKVWVSENGVFAFGFLEVDGDGGDEYMVGIMYNLGDKAANLPVWTVGSGIRVPVNSTFRFAMDGRLVLINNYSRTTLWSSNTSNLGVQKANLLDSGNLVLLSSKDEVVWDSFGSPTNTLLPGQSIHFPQNLRALPTRLIASYYNLVIRQDGELALVWEYNVTYWKSPVGSKEARFDSNGVLGLYDGSGKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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