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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001419`

染色体: Chr07 坐标: 11035070-11038120 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001419`
名称	SmilChr07G001419
描述	flavonoid 8-hydroxylase 2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	11035070 - 11038120 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992586`
GeneID	`130992586`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992586`
原始查询	`SmilChr07G001419`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	flavonoid 8-hydroxylase 2, chloroplastic-like
产物	flavonoid 8-hydroxylase 2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G25650` (ACD1-LIKE) ACD1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828670] identity=60; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0805700` - identity=47; qcov=0.954; evalue=5.18e-162; confidence=high
GO	GO:0010277 (chlorophyllide a oxygenase activity); GO:0051537 (2 iron, 2 sulfur cluster binding)
KEGG	-
Pfam	PF00355 (Rieske); PF08417 (PaO)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992586

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057773258.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057773258.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057773258.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773258.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773258.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:11035305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B43,B86,C41,C48
`Chr7:11035329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,A4,B87
`Chr7:11035362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A4,B129,B13,B87
`Chr7:11035374`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B122,C44,C63,C67
`Chr7:11035417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B122,C44,C63,C67
`Chr7:11035461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,C25,C3,D1
`Chr7:11035472`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	138	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A20,A21,A22,A23,A3,A7,A8,A9,B10,B100,B103,B105,B106,B107,B109,B110,B113,B114,B120,B121,B122,B127,B129,B13,B132,B133,B134,B136,B137,B17,B18,B21,B23,B25,B26,B27,B29,B30,B32,B34,B35,B36,B38,B40,B41,B44,B45,B46,B56,B60,B61,B64,B65,B67,B71,B72,B73,B75,B76,B77,B8,B80,B84,B85,B86,B87,B88,B93,B94,B96,B97,B99,C11,C13,C14,C16,C17,C18,C19,C2,C22,C23,C24,C26,C27,C28,C29,C30,C31,C32,C35,C36,C37,C38,C40,C42,C44,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C54,C55,C56,C61,C63,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C74,C75,C77,C78,C79,C80,C81,C82,C83,C84,C86,C87,D1,D10,D8
`Chr7:11035484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,A16,B40,B76,C86
`Chr7:11035504`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	44	A10,A16,A7,A8,A9,B105,B120,B121,B122,B129,B136,B18,B23,B29,B35,B40,B46,B56,B61,B72,B75,B76,B85,B88,B93,B96,C16,C17,C19,C22,C24,C30,C38,C47,C5,C7,C70,C72,C75,C78,C81,C82,C83,D8
`Chr7:11035512`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	45	A10,A16,A7,A8,A9,B105,B120,B121,B122,B129,B136,B18,B23,B29,B35,B40,B46,B56,B61,B72,B75,B76,B80,B85,B88,B93,B96,C16,C17,C19,C22,C24,C30,C38,C47,C5,C51,C7,C70,C75,C78,C81,C82,C83,D8
`Chr7:11035527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	84	A1,A11,A13,A16,A18,A23,A3,A7,B10,B100,B103,B107,B109,B110,B113,B114,B121,B127,B132,B133,B134,B137,B17,B21,B25,B26,B27,B30,B32,B34,B36,B38,B40,B44,B45,B57,B61,B64,B67,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B80,B84,B86,B88,B89,B94,B97,B99,C10,C11,C13,C14,C17,C18,C2,C26,C27,C28,C29,C31,C32,C35,C37,C46,C48,C50,C55,C56,C61,C68,C69,C71,C74,C77,C79,C80,C84,C86,C87
`Chr7:11035546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773258.1

540 aa

270

540

Rieske

PaO

PF00355 Rieske 83-167 aa PF08417 PaO 298-401 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773258.1`	Pfam	`PF00355`	Rieske	Domain	83	167	1.4e-23	83.3	Rieske [2Fe-2S] domain
`XP_057773258.1`	Pfam	`PF08417`	PaO	Family	298	401	6.1e-27	94.3	Pheophorbide a oxygenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917275.1
ACTCCTTCATAAATAGAAGTAGGAAAAAGTATCGGAAAAATCAGGCAAACTTTGCTGGAAGATTTCAAGCCATAATCTCATTTCGTACCTTATCCGCAAAAAACTCTCACATTATTTGCTAGTTTTTGCATGCGATTGTCGTTTCTTGTAAATTATATATCTACCTTTGGATGGAATTGAAATTGAATCAGTGTTGAAACGGGTGACGAACTGTCAGCCATGGAAGCTCTAAAAGCTTCATCTTTTCCATCATTCCACCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992586
ATGGAAGCTCTAAAAGCTTCATCTTTTCCATCATTCCACCGCCAACCCATCTCAAGGCGAAATCCCAGGAACGCATTCGAAAAACCCATTCTGCATATCCCGTCATCTCGACGAATCCCGACGACTTTCCAGAAATCGAATTCCAAGATTTTCACCGCAGTTTCTCCGACGACGGTGGAATCTTCGGCGCCTCCCGATGAGGAGATTGAATCCGAGAAGAGAGAGGAAAAATTCGATTGGTACGAGCAGTGGTATCCGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773258.1
MEALKASSFPSFHRQPISRRNPRNAFEKPILHIPSSRRIPTTFQKSNSKIFTAVSPTTVESSAPPDEEIESEKREEKFDWYEQWYPVWPVCDLDKRRPHARKVIGIDVVVWWDRNENAWKVFEDSCPHRLAPLSEGRIDQWGRLQCVYHGWCFGGAGDCKFIPQAPRDGPPVHTSNKACVAVYPSCVQNGILWFWPNSDPHYKDIYSTKKPHYIPELDDPSYTNTMIARDIGYGYEVLIENLMDPAHVPYAHYGIMRTGK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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