当前解析结果
SmilChr07G001437| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001437 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001437 |
| 描述 | 5'-adenylylsulfate reductase-like 5 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 11148660 - 11152103 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992649 |
|---|---|
| GeneID | 130992649 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992649 |
| 原始查询 | SmilChr07G001437 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | 5'-adenylylsulfate reductase-like 5 |
| 产物 | 5'-adenylylsulfate reductase-like 5 |
| Arabidopsis | AT3G03860 (APRL5)APR-like 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821101] identity=45.92; qcov=0.948; evalue=1.07e-92; confidence=high |
| Rice | Os03g0806500 (OsAPRL5)- identity=40.54; qcov=0.843; evalue=5.32e-63; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00085 (Thioredoxin); PF27914 (APRL7_C) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992649 |
特征证据限制:抽查两个保留的历史缓存共 206 行,PROFEAT 特征全部为零;第二块缓存为 106 行,比对应 FASTA 的 100 个蛋白多 6 个。ESM2 特征在抽查范围内为有限非零值。缓存与当前定位结果的历史执行链仍未核实,不能据蛋白编号重合认定这些特征用于线上预测,也不能将抽查推广到全蛋白组。当前结果仅作为探索性候选,特征完整性与预测可靠性尚未建立。
| Rank | 定位位置 | 中文 | 五折投票比例 | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057773360.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.80000 | XP_057773360.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:11151653 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C14 |
Chr7:11151689 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B126,B131,D11 |
Chr7:11151720 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A1,B84,C62 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057773360.1PF00085
Thioredoxin 61-157 aa
PF27914
APRL7_C 193-265 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057773360.1 |
Pfam | PF00085 |
Thioredoxin | Domain | 61 | 157 | 1.2e-06 | 29.2 | Thioredoxin |
XP_057773360.1 |
Pfam | PF27914 |
APRL7_C | Domain | 193 | 265 | 3e-32 | 111.4 | 5'-adenylylsulfate reductase 7, C-terminal domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。