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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001438`

染色体: Chr07 坐标: 11152126-11154133 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001438`
名称	SmilChr07G001438
描述	uncharacterized SmilChr07G001438
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	11152126 - 11154133 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992685`
GeneID	`130992685`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992685`
原始查询	`SmilChr07G001438`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832138]; symbol=AT5G20160; hit=AT5G20160; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832138]; symbol=AT5G20160; hit=AT5G20160; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G20160` (AT5G20160) Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832138] identity=74.4; qcov=1.25; evalue=1.32e-77; confidence=high
Rice	`Os03g0241200` - identity=93; qcov=1; evalue=4.15e-75; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005730 (nucleolus); GO:0030490 (maturation of SSU-rRNA); GO:0031428 (box C/D methylation guide snoRNP complex); GO:0032040 (small-subunit processome); GO:0042254 (ribosome biogenesis); GO:0046540 (U4/U6 x U5 tri-snRNP complex); GO:0071011 (precatalytic spliceosome)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01248 (Ribosomal_L7Ae)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992685

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057773419.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057773419.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057773419.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773419.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773419.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:11152704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr7:11152953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773419.1

128 aa

128

Ribosomal_L7Ae

PF01248 Ribosomal_L7Ae 22-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773419.1`	Pfam	`PF01248`	Ribosomal_L7Ae	Domain	22	111	1e-27	96.3	Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917436.1
CCAATTAATTTAAAATGTCAATTGCTTTTGCTCCCCTATATATGTAAAAGCAATGGTACATTCATAAGGTGGTCTCATTTTGGTTTTTCAATGTTTTTTTGGAAGGTTTCTCAGTACTTTGGCAAAAAAAGAGCATAATTTTTTTGTGCTTTTTACTCACAATTATTTAAGTATTAAAAACTTTATGGTACATTCATATTCATATACTAGTATAAGGCAATTTCAGATATCTCCCAATTCTTTCCTATTTTAATTTGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992685
ATGACTGCAGAAGCCGTGAACCCGAAAGCATATCCGTTGGCAGATGCCCAGCTGATCACTACTATACTTGATTTGGTTCAACAAGCCGCCAACTACAAACAACTCAAAAAGGGCGCTAATGAAGCTACTAAGACGTTGAACCGTGGGATTTCTGAATTTGTTGTGATGGCGGCTGATACAGAGCCTCTTGAAATCCTCCTTCACCTTCCGCTTCTTGCTGAAGATAAGAATGTGCCCTATGTTTTTGTTCCATCCAAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773419.1
MTAEAVNPKAYPLADAQLITTILDLVQQAANYKQLKKGANEATKTLNRGISEFVVMAADTEPLEILLHLPLLAEDKNVPYVFVPSKQALGRACGVTRPVIACSVTSNEGSQLKSQIQQLKDAIEKLLI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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